./070 で躓いてしまいました。

[Mike-JH0912]

Java　jdk８を入れた後、. ./070(以下、省略）をRunしました。 Run後に以下のNOエラーメッセージが出てしまいました。 Run後に作成されたDRR006760.sort.dedup.bamファイルは700KB 程度ですので、 途中で止まってしまったようです。 原因とトラブルシュートについて、アドバイスをいただけますと助かります。

RUNが終わった後に出てきたメッセージは以下です。

# A fatal error has been detected by the Java Runtime Environment:
#  SIGSEGV (0xb) at pc=0x0000000138742ea7, pid=2777, tid=8451
# JRE version: OpenJDK Runtime Environment (13.0.2+8) (build 13.0.2+8)
# Java VM: OpenJDK 64-Bit Server VM (13.0.2+8, mixed mode, sharing, tiered, compressed oops, g1 gc, bsd-amd64)
# Problematic frame:
# C  [libgkl_compression15963065237728019358.dylib+0x6ea7]  deflate_medium+0x867
# No core dump will be written. Core dumps have been disabled. To enable core dumping, try "ulimit -c unlimited" before starting Java again

JDK8をインストールしたのですが、Open JDKが動いてしまいエラーにつながったのでしょうか？ try "ulimit -c unlimited"　というのは、試していません。 よろしくお願いいたします。

[Mike-JH0912]

その後、JAVAの入れ直しをしたところ、次に進めました。 お騒がせしました。