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最初の赤枠6行目に関して、010_download-ucsc.shの場所が今日gitから落としたファイルだと ngsdat2-master/DiseaseGenomeMain/ に変更されていました。 そのため同赤枠5行目はcd ngsdat2-master/DiseaseGenomeMain/とする必要があります。 (2020/11/22時点)
ご指摘ありがとうございます。
確かに、本編のスクリプト群は、zipファイル展開後の ngsdat2-master/DiseaseGenomeMain/以下にありますので、ご指摘通りp66の赤枠5行目はcd ngsdat2-master/DiseaseGenomeMainとすべきです。正誤表にも追加しておきます。
ngsdat2-master/DiseaseGenomeMain/
cd ngsdat2-master/DiseaseGenomeMain
最初の赤枠6行目に関して、010_download-ucsc.shの場所が今日gitから落としたファイルだと ngsdat2-master/DiseaseGenomeMain/ に変更されていました。 そのため同赤枠5行目はcd ngsdat2-master/DiseaseGenomeMain/とする必要があります。 (2020/11/22時点)