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misshie / ngsdat2

NGS Data Analysis Textbook Version 2 (Disease Genome Analysis)
MIT License
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p72に関して再度の質問失礼致します。 #23

Open Taro12345789 opened 3 years ago

Taro12345789 commented 3 years ago

Dry解析に関しては全くの初学者であり、この本を用いて勉強させていただいております。 以前も別の方が、p72のScripts/sort-bed.rb ccds.bed > ccds.sort0.bedに関して質問されておりましたが、その記事を参考にしてもうまく進まないのですが、Scripts/sort-bed.rb ccds.bedの部分をDiseaseGenomeValidation/Scripts/sort-bed.rbに置き換えるということでしょうか？理解が悪く申し訳ございませんが、ご教授頂けますと幸いです。どうぞよろしくお願い申し上げます。

misshie commented 3 years ago

Issuesへの対応が遅くなり申し訳ありません。

約６が月前に DiseaseGenomeValidation/Scripts/sort-bed.rbを DiseaseGenomeMain/Scripts/sort.bed.rbにコピーする修正を行いました。

再度ダウンロードしていただくか、手動（mvコマンド）でコピーしていただければ、動くはずです。また、実際にはpwdコマンドでカレントディレクトリがどこかご確認下さい。コマンドラインの使い方、p22-24、p28もあわせてご参照下さい。