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NGS Data Analysis Textbook Version 2 (Disease Genome Analysis)
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p.68のDRR006760のダウンロードについて #27

Closed nakane-scc closed 3 years ago

nakane-scc commented 3 years ago

$ ./030_download-dra.sh を実行したところ、 (7) Failed to connect to ftp.ddbj.nig.ac.jp port 21 というエラーが発生しました。そこで、 030_download-dra.shの site="ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp" の箇所を site="https://ddbj.nig.ac.jp" と書き換えたところ、エラーメッセージは消えたものの、 % Total % Received % Xferd Average Speed Time Time Time Current Dload Upload Total Spent Left Speed 100 293 100 293 0 0 3855 0 --:--:-- --:--:-- --:--:-- 3855 -rw-r--r-- 1 ユーザー グループ 293B 4 15 13:07 DRR006760.sra と、ファイルの中身が入っておりませんでした。

https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/run?acc=DRR006760 にアクセスし、ページ上部の「SRA」をクリックしてみたのですが、ページを開くことができず、サイトの不具合かと思ったのですが、いかがでしょうか。

nakane-scc commented 3 years ago

ネットのセキュリティの問題だったようです。