Closed famosab closed 5 days ago
Somehow I still get these linting warnings:
╭─ [!] 4 Module Test Warnings ──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╮
│ ╷ ╷ │
│ Module name │ File path │ Test message │
│╶─────────────┼───────────────────────────────────┼───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╴│
│ datavzrd │ modules/nf-core/datavzrd/main.nf │ Unable to connect to container registry, code: 404, url: https://community.wave.seqera.io/library/datavzrd:2.36.12--593eb75e566b7f2a │
│ datavzrd │ modules/nf-core/datavzrd/main.nf │ Container versions do not match │
│ datavzrd │ modules/nf-core/datavzrd/meta.yml │ config_file is present as an input in meta.yml but not in main.nf │
│ datavzrd │ modules/nf-core/datavzrd/meta.yml │ table is present as an input in meta.yml but not in main.nf │
│ ╵ ╵ │
╰───────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────╯
The meta ones confuse me.
PR checklist
Closes #2511 Replaces #5882
versions.yml
file.label
nf-core modules test <MODULE> --profile docker
nf-core modules test <MODULE> --profile singularity
nf-core modules test <MODULE> --profile conda
nf-core subworkflows test <SUBWORKFLOW> --profile docker
nf-core subworkflows test <SUBWORKFLOW> --profile singularity
nf-core subworkflows test <SUBWORKFLOW> --profile conda