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Problem mit Parameter "Name" #3

Closed mschwentner closed 2 years ago

mschwentner commented 2 years ago

Hi Martin,

hab die pipeline gestartet. Hat folgenden Fehler gezeigt:

Please see below, which parameter is missing:

Name=Yeti_01 is missing: The name of the sample needs to be specified

ich habe bei mir gesetzt:

Name=Pleustid \ OutputFolder=/media/inter/mschwentner/Genome_assembly_test/test1lib \ Fwd=/media/inter/mschwentner/Illumina_trimmed/C16_1_val_1.fq.gz \ Rev=/media/inter/mschwentner/Illumina_trimmed/C16_2_val_2.fq.gz \ ONT=/media/inter/mschwentner/MinIon_runs/HAC/HAC_C16II_pass \ BuscoDB=arthropoda_odb10

Dann solllte er eigentlich doch den Parameter name als Pleustid erkennen, oder? Eine Idee was ich da falsch gesetzt habe?

Beste Grüße, Maartin

capoony commented 2 years ago

Lieber Martin, Du musst vor jeden Zeilenumbruch einen Backslash setzen, das könnte das Problem gewesen sein. I.e. 

Name=Pleustid \
OutputFolder=/media/inter/mschwentner/Genome_assembly_test/test1lib \
Fwd=/media/inter/mschwentner/Illumina_trimmed/C16_1_val_1.fq.gz \
Rev=/media/inter/mschwentner/Illumina_trimmed/C16_2_val_2.fq.gz \
ONT=/media/inter/mschwentner/MinIon_runs/HAC/HAC_C16II_pass \
BuscoDB=arthropoda_odb10

Cheers, Martin