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nhochberger / NuFi

Im Rahmen einer Studienarbeit entwickeltes Tool zum Detektieren von Objekten in Zellkernen.
Apache License 2.0
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Changes to image processing #35

Open nhochberger opened 9 years ago

nhochberger commented 9 years ago
  1. duplicate channel 3
  2. gaussian blur with large (configurable) radius (~100 to start with) on duplicate
  3. subtract the blurred image from channel 3 image
  4. gaussian blur with small (configurable) radius (~3 to start with) on result
  5. continue with image analysis as is (thresholding, particle analysis, find ROIs,...)
nhochberger commented 9 years ago

"Das Originalbild wird üblicherweise wirklich durch das Untergrundbild geteilt (Kap. 7.3 Digitale Bildver., S. 239). Das Verfahren macht dann auch die Thresholding-methoden stabiler gegenüber Helligkeitsvariationen und ist für uns auf jeden Fall nötig. (Wird im Segmentierungskapitel erwähnt). Da man nur kleine Pixelhelligkeitswerte bekommt und deswegen schnell ein schwarzes Bild erhält, wie wir gestern, wird das Resultat dann mit einer Konstanten (eventuell halber Maximalwert 178?) multipliziert."