search

nlmixr2 / rxode2et

https://nlmixr2.github.io/rxode2et/
1 stars 1 forks source link

Importing dataset crashes R #41

Closed mattfidler closed 5 months ago

mattfidler commented 5 months ago

See

https://github.com/nlmixr2/rxode2/issues/670

  e <- et()

  e$importEventTable(data.frame(ID = c("A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131", "A131",
                                       "A131", "A131", "A131", "A131", "A132", "A132", "A132", "A132",
                                       "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132",
                                       "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132",
                                       "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132",
                                       "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132", "A132",
                                       "A132", "A132", "A132", "A132", "A133", "A133", "A133", "A133",
                                       "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133",
                                       "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133",
                                       "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133",
                                       "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133", "A133",
                                       "A133", "A133", "A133", "A134", "A134", "A134", "A134", "A134",
                                       "A134", "A134", "A134", "A134", "A134", "A134", "A135", "A135",
                                       "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135",
                                       "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135",
                                       "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135", "A135",
                                       "A135", "A135", "A135", "A135", "A135"),
                                TIME = c(0, 0, 1.3,
                                         1.883333333, 2.766666667, 4.85, 6.883333333, 7.816666667, 23.81666667,
                                         47.81666667, 71.81666667, 95.81666667, 166.2, 166.2, 190.2, 214.2,
                                         238.2, 262.2, 332.3333333, 332.3333333, 332.95, 333.5333333,
                                         334.5333333, 336.5333333, 338.5333333, 339.45, 355.45, 379.45,
                                         403.45, 427.45, 504.3166667, 504.3166667, 528.3166667, 552.3166667,
                                         576.3166667, 672.3166667, 696.3166667, 720.3166667, 744.3166667,
                                         840.3166667, 864.3166667, 888.3166667, 909.5333333, 909.5333333,
                                         910.3666667, 910.8166667, 911.7, 913.45, 915.4, 917, 1009.783333,
                                         1009.783333, 1012.3, 1034.3, 1058.3, 1082.3, 1178.3, 1202.3,
                                         1226.3, 1250.3, 2016.1, 2016.1, 2040.1, 2064.1, 2088.1, 2184.1,
                                         2208.1, 2232.1, 2256.1, 2352.1, 2376.1, 2400.1, 2424.1, 2522.1,
                                         2522.1, 2522.45, 2544.45, 2568.45, 2592.45, 2688.45, 2712.45,
                                         2736.45, 2760.45, 2856.45, 2880.45, 2904.45, 2928.45, 3025.8,
                                         3025.8, 3028.266667, 3050.266667, 3074.266667, 3098.266667, 3194.266667,
                                         3218.266667, 3242.266667, 3266.266667, 0, 0, 0.85, 24.35, 48.35,
                                         72.35, 96.35, 336.35, 360.35, 384.35, 408.35, 432.35, 500.7,
                                         500.7, 503.0166667, 525.0166667, 549.0166667, 573.0166667, 597.0166667,
                                         666.1333333, 666.1333333, 666.9833333, 667.4833333, 668.4833333,
                                         669.9833333, 672.0333333, 673.7, 689.7, 713.7, 737.7, 761.7,
                                         833.7, 881.7, 905.7, 1001.7, 1025.7, 1049.7, 1082.816667, 1082.816667,
                                         1085.7, 0, 0, 1.616666667, 2.033333333, 2.866666667, 4.866666667,
                                         6.283333333, 24.28333333, 170.2833333, 170.2833333, 194.2833333,
                                         218.2833333, 242.2833333, 261.6833333, 333.1666667, 357.1666667,
                                         381.1666667, 405.1666667, 429.1666667, 505.35, 505.35, 508.3333333,
                                         530.3333333, 554.3333333, 578.3333333, 595.4, 595.4, 596.9333333,
                                         666.9333333, 690.9333333, 714.9333333, 738.9333333, NA, NA, NA,
                                         NA, NA, NA, NA, 0, 0, 1.133333333, 1.716666667, 2.633333333,
                                         4.416666667, 6.216666667, 24.21666667, 48.21666667, 72.21666667,
                                         96.21666667, 0, 0, 0.9666666667, 1.466666667, 2.266666667, 4.35,
                                         6.016666667, 24.01666667, 48.01666667, 168.0166667, 192.0166667,
                                         216.0166667, 240.0166667, 264.0166667, 336.0166667, 360.0166667,
                                         384.0166667, 408.0166667, 432.0166667, 503.3, 503.3, 505.9, 527.9,
                                         551.9, 575.9, 599.9, 1175.566667, 1175.566667, 1178, 1200, 1224
                                         ),
                                CMT = c("central", "depot", "central", "central", "central",
                                        "central", "central", "central", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "central", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "central",
                                        "depot", "central", "central", "central", "central", "central",
                                        "central", "depot", "depot", "depot", "depot", "central", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "central", "depot", "central", "central",
                                        "central", "central", "central", "central", "central", "depot",
                                        "central", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "central", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "central", "depot", "central", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "central", "depot", "central", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "central", "depot", "central", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "central", "depot", "central", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "central", "depot", "central", "central", "central",
                                        "central", "central", "central", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "central",
                                        "depot", "central", "central", "depot", "central", "central",
                                        "central", "central", "central", "depot", "central", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "depot", "central", "depot", "central", "depot", "depot",
                                        "depot", "central", "depot", "central", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "central", "central", "central", "central", "central",
                                        "central", "central", "central", "depot", "central", "central",
                                        "central", "central", "central", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "central", "depot", "central", "central", "central", "central",
                                        "central", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot",
                                        "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "depot", "central",
                                        "depot", "central", "depot", "depot", "depot", "depot", "central",
                                        "depot", "central", "depot", "depot"),
                                AMT = c(NA, 400, NA, NA,
                                        NA, NA, NA, NA, 400, 400, 400, 400, NA, 400, 400, 400, 400, 400,
                                        NA, 400, NA, NA, NA, NA, NA, NA, 400, 400, 400, 400, NA, 400,
                                        400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, NA, 400, NA,
                                        NA, NA, NA, NA, NA, NA, 400, NA, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                        400, NA, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                        400, NA, 400, NA, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                        400, 400, NA, 400, NA, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, NA,
                                        500, NA, 500, 500, 500, 500, 450, 450, 450, 450, 450, NA, 450,
                                        NA, 450, 450, 450, 450, NA, 450, NA, NA, NA, NA, NA, NA, 450,
                                        450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, NA, 450, NA, NA,
                                        350, NA, NA, NA, NA, NA, 350, NA, 300, 300, 300, 300, 300, 300,
                                        300, 300, 300, 300, NA, 300, NA, 300, 300, 300, NA, 300, NA,
                                        300, 300, 300, 300, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, 350, NA,
                                        NA, NA, NA, NA, 350, 350, 350, 350, NA, 400, NA, NA, NA, NA,
                                        NA, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                        NA, 400, NA, 400, 400, 400, 400, NA, 400, NA, 400, 400),
                                DOSE = c(0,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 0, 500, 500, 500, 500, 500, 500, 450,
                                         450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450,
                                         450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450, 450,
                                         450, 450, 450, 450, 450, 450, 0, 350, 350, 350, 350, 350, 350,
                                         350, 350, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300,
                                         300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300, 300,
                                         300, 300, 300, 300, 300, 300, 0, 350, 350, 350, 350, 350, 350,
                                         350, 350, 350, 350, 0, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400,
                                         400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400, 400),
                                EVID = c(0, 1,
                                         0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0,
                                         0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1,
                                         0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 1, 1, 1,
                                         1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
                                         1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
                                         1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1,
                                         1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 1,
                                         1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1, 1, 0,
                                         0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 0,
                                         0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 1, 0, 1, 1, 1,
                                         1, 0, 1, 0, 1, 1),
                                COVAR = c(1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1,
                                          0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1,
                                          1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 1,
                                          0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
                                          0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
                                          0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
                                          0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
                                          1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
                                          0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
                                          0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,
                                          0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0)
                                ))