입원시 진단에 대한 Condition_type_concept_id 구분 여부

[jesusl-ks]

안녕하세요. 분당서울대병원 김석 연구원입니다.

CDM 데이터로 population estimation effect analysis 연구를 수행하면서 T과 C의 매칭을 위해 covariate를 설정하여 사용하였었습니다. 그런데 최근 "Condition - Primary Inpatient"라는 covariate를 선택하는 것이 visit_occurrence와 join하여 입원(visit_concept_id=9201) 진단을 판단하는 것이 아니라 condition_type_concept_id로 구분하는 것을 확인하게 되었습니다.

• cohort method R package에 저장되어 있는 SQL Query 확인

구글링을 해 보니 아래와 같은 논의가 있었으며, 여기에서 얘기하고 있는 4가지 type_concept_id가 "Condition - Primary Inpatient"를 선택했을 때 적용되는 것과 동일하였습니다.

• https://github.com/OHDSI/ETL-CMS/issues/33

그래서... 혹시 다른 의료기관에서는 condition_type_concept_id를 사용하여 입원시 진단을 구분하고 있나요? 구분하고 있다면 입원시 주진단과 부진단을 별도의 type_concept_id로 구분하나요?

구분하지 않는다면... Estimation 분석시 "Condition - Primary Inpatient" covariate는 R package를 수정하여 사용해야 할까요?

[chandryou]

안녕하세요, 제가 정확하게는 알지 못하나 'condition'에 대한 'attribute'를 추가할 때 'visit'와 'condition type'을 따로 추가할 수 있습니다.

보통은 'visit'에 'inpatient'나 'ER'을 추가하고 'condition type'에 'primary'을 추가하여 'inpatient'진단이면서 'primary condition'을 찾을 수 있지 않을까 합니다.

[jesusl-ks]

안녕하세요. 확인 감사드립니다.

혹시 Estimation(Cohort Method) 분석하실 때, "Condition - Primary Inpatient"라는 covariate는 사용하시지 않는지 문의드립니다.

[chandryou]

아 FeatureExtraction package 에서 useConditionOccurrencePrimaryInpatient 을 사용할 때는, condition_type_concept_id 가 38000183, 38000184, 38000199, 38000200 인 것을 이용하고 있네요.. 말씀해주신대로, condition_type_concept_id 를 어떻게 정의할 지에 대해서도 논의가 필요할 것 같습니다.

OHDSI Forum 에도 질문을 올렸습니다. 좋은 질문 감사 드립니다.

@jesusl-ks