병리결과 입력 방법

ohdsi-korea / ThemisKorea

한국 THEMIS 워킹 그룹 github입니다.

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Closed chandryou closed 5 years ago

chandryou commented 5 years ago

병리결과에 예를들어 Positive/Negative같이 정량적으로 보고가 되는 데이터는 Measurement에 넣나요? 병리결과는 Text여서 아산에서는 Note 테이블에 일단 데이터를 넣었는데 NLP로 처리하면 Measurement로 넣어야 하나 궁금합니다.

chandryou commented 5 years ago

먼저 현재 진행 중이지만 Oncology CDM Proposal을 참고해보셔야 할 것 같습니다.

현재의 Proposal 대로라면 병리 텍스트 중 정리된 데이터는 Measurement 로 들어가게 되어 있습니다. (Measurement type concept id = 32423)

Jimyung6642 commented 5 years ago

NOTE 테이블에는 비정형 free text 데이터가 입력되는 것으로 정의되어있습니다. (https://github.com/OHDSI/CommonDataModel/wiki/NOTE)

그렇기 때문에 NLP 로 가공된 데이터라면 Measurement, Observation, Note_NLP 등의 다른 테이블로 넣는 것이 바람직해보입니다.