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openbiox / UCSCXenaShiny

📊 An R package for interactively exploring UCSC Xena https://xenabrowser.net/datapages/; Book: https://lishensuo.github.io/UCSCXenaShiny_Book; App online: https://shiny.hiplot.cn/ucsc-xena-shiny/, https://shiny.zhoulab.ac.cn/UCSCXenaShiny
https://openbiox.github.io/UCSCXenaShiny/
GNU General Public License v3.0
83 stars 29 forks source link

PharmacoGenomics_0123 #304

Closed mugpeng closed 4 months ago

mugpeng commented 5 months ago

Ref: https://github.com/mugpeng/OmicsPharDB/

ShixiangWang commented 5 months ago

@mugpeng Thanks for your PR.

@lishensuo Please take a look and test for potential optimization and updates.

ShixiangWang commented 5 months ago

最近我会先根据 https://github.com/mugpeng/OmicsPharDB 给你一些 comments 看看你那边还能不能优化 @mugpeng 文章会把这部分纳入，你有空配合下申锁 @lishensuo 准备下相关的数据/材料哈。

这个 PR 我跟申锁聊过了，由于 app.R preprocess 数据大的原因目前特别是对于本地安装使用该 shiny 可能会造成困扰，我会在一个月内抽空解决这个问题（无论是好方案坏方案），然后再执行合并操作。

mugpeng commented 5 months ago

OK，咱们直接在群里沟通吧。github 看的可能不够及时。

ShixiangWang commented 5 months ago

OK，咱们直接在群里沟通吧。github 看的可能不够及时。

可以

ShixiangWang commented 4 months ago

标记下跟数据有关的变量：

omics_search_list1
omics_search_list2
omics_search_list1_sel
omics_search_list2_sel
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profile1
profile2