openbiox / UCSCXenaShiny

📊 An R package for interactively exploring UCSC Xena https://xenabrowser.net/datapages/; Book: https://lishensuo.github.io/UCSCXenaShiny_Book; App online: https://shiny.hiplot.cn/ucsc-xena-shiny/, https://shiny.zhoulab.ac.cn/UCSCXenaShiny
https://openbiox.github.io/UCSCXenaShiny/
GNU General Public License v3.0
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第一阶段开发任务 #8

Closed ShixiangWang closed 5 years ago

ShixiangWang commented 5 years ago

目的

开发基本的Home页面以及Repository页面。

开发使用Shiny模板shinythemes https://rstudio.github.io/shinythemes/

绘图使用echarts4r https://echarts4r.john-coene.com/articles/get_started.html

要求

Home页面

介绍Xena Shiny并给出汇总信息,类似于GDC(https://portal.gdc.cancer.gov/)或TCIA(https://tcia.at/home)。一开始不用好看,主要是能整出个大致的框架

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Repository页面

提供数据集的搜索、选择、下载功能。

页面左侧提供一些选择框

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页面右侧提供用户过滤选择后数据集表格,默认可以展示所有信息(类似https://portal.gdc.cancer.gov/repository),表格需要支持链接,以便于后续开发。

任务领取

一开始可以自己构造数据实现原型。仓库Shiny已经写好了如何导入Xena数据集信息。

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下面是5个任务。

整个类似下面的。左上方显示XenaShiny,然后包含3个页面,标签为Home、Repository和Developers

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类似

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发挥自己的创造力,类似(我说的是形式类似,并不是具体的数据实现要一样)

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我最近花时间仔细研究下如何获取更多的Xena信息和底层代码,以及根据情况参与以上4项任务中。

加油!

fei0810 commented 5 years ago

@ShixiangWang 我这两天用argonDash 写写我现在在做的网页,踩踩坑。

ShixiangWang commented 5 years ago

@fei0810 不用使用argon了,大家多票支持Shinythemes~