Closed xiashj3027 closed 1 year ago
目前的报表都是已经经过FDR筛选过的,匹配质量都是比较高的。不建议单独筛选,除非要看某一条特定的糖肽。
如果真要单独筛选,最好还是用pepscore和glyscore,这样能够保证肽和糖的匹配质量都较高。
了解了,感谢! ------------------ Original ------------------ From: @.>; Date: Sun, Oct 9, 2022 03:24 PM To: @.>; Cc: @.>; @.>; Subject: Re: [pFindStudio/pGlyco3] 关于pGlyco结果筛选的问题 (Issue #18)
目前的报表都是已经经过FDR筛选过的,匹配质量都是比较高的。不建议单独筛选,除非要看某一条特定的糖肽。
如果真要单独筛选,最好还是用pepscore和glyscore,这样能够保证肽和糖的匹配质量都较高。
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您好!请问pGlyco输出的结果中,如何根据三个分值(total score,peptide score和glycan score)初步筛选所要保留的结果呢?是否有推荐的cut off值?此外,如果total score很高,但对应的pepscore和glyscore其中一个很低,通常这种结果怎么处理呢?是否需要逐张检查PSM图?谢谢!