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COVID-19 Italia - Monitoraggio situazione
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Dati mortalità per provincia #378

Closed aldogangemi closed 4 years ago

aldogangemi commented 4 years ago

Tipo di issue:

Riassunto

Non vengono riportati i dati dei decessi

Attesa: Dati dei decessi per provincia

Attuale: Solo i dati dei casi totali per provincia sono presenti

dstreppa commented 4 years ago

+1

pnicorelli commented 4 years ago

issue #191

cassiudders commented 4 years ago

credo sarebbe difficile da decifrare perchè la logica è di registrare i morti in base alla provincia di ospedalizzazione e non a quella di residenza

aldogangemi commented 4 years ago

meglio l'approssimazione per provincia di ospedalizzazione che niente però, tanto più che l'analisi della mortalità rispetto alle medie e alla mortalità totale si sta rivelando una misura attendibile per monitorare l'evoluzione dell'epidemia

cassiudders commented 4 years ago

aldogangemi vedi che l'evoluzione dell'epidemia la analizzi con i contagi molto meglio che con la mortalità...la mortalità in realtà è molto connessa all'età media dei contagiati. comunque in alcune regioni la sto ricavando dai comunicati e dalle agenzie....se ti interessa quando la metto online te lo scrivo

aldogangemi commented 4 years ago

sì certo, ma visto che il conteggio dei contagi non è omogeneo in quanto dipendente dalla disponibilità e sistematicità dei test, provo analisi multifattoriali. D’altra [parte anche il conteggio dei decessi può essere influenzato da come vengono categorizzati, quindi un riscontro con la mortalità media fornisce un ulteriore angolo.

On 27 Mar 2020, at 23:59, cassiudders notifications@github.com wrote:

aldogangemi vedi che l'evoluzione dell'epidemia la analizzi con i contagi molto meglio che con la mortalità...la mortalità in realtà è molto connessa all'età media dei contagiati. comunque in alcune regioni la sto ricavando dai comunicati e dalle agenzie....se ti interessa quando la metto online te lo scrivo

— You are receiving this because you authored the thread. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/pcm-dpc/COVID-19/issues/378#issuecomment-605348738, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AB52OND53IUHLRGICPOFGADRJUVVRANCNFSM4LUMXASA.

cassiudders commented 4 years ago

aggiungerò anche in nota la differenza....in realtà in Veneto usano la provincia di ospedalizzazione, altrove quella di domicilio o residenza. e andrebbe considerata anche la differente disponibilità di strutture adeguate

magaspari commented 4 years ago

Aldo ha ragione, credo anche io che sarebbe molto importante avere a disposizione i dati sui decessi per provincia di residenza. Il dato si trova certamente nei documenti e sarebbe opportuno considerare quello. Se viene riportata invece la provincia di ospedalizzazione il dato non serve a molto e va ad inficiare anche i dati delle regioni. Quanti sono i decessi attribuiti alla ER di pazienti residenti in Lombardia? Questo dato dovrebbe essere armonizzato a livello nazionale, riportando ovunque la provincia di residenza dei decessi, e diffuso con granularità provinciale in modo da poter valutare se i dati sui contagi delle diverse provincie sono realistici o ampiamente sottostimati. Sembra che i dati sui decessi ci sono in realtà e che contengono altre informazioni quali eta', sesso, patologie pregresse. Mi sembra strano che non contengano anche la residenza? Perché non vengono messi a disposizione?

cassiudders commented 4 years ago

difetti di fabbricazione del federalismo.....ogni azienda sanitaria li gestisce a modo suo, senza protocolli troppo specifici nè uniformi....purtroppo per la Lombardia non ho trovato traccia in rete di bollettini con suddivisioni provinciali. i casi sono due: o i dati sono troppo preoccupanti per essere divulgati o magari nella zona in questione il mare magno di situazioni e di criticità non consente a nessuno di avere il tempo di rilevare dettagli simili. in Emilia-Romagna si trovano delle agenzie, lo stesso in Toscana con età, sesso e provenienza dettagliate, mentre per Marche e Veneto si possono rintracciare addirittura i PDF con tanti dettagli

cassiudders commented 4 years ago

ecco il bollettino del Veneto di stamattina che anticipa i dati che questo github renderà in CSV fra un'ora: https://www.ilgiornaledivicenza.it/filedelivery/policy:7.2739044:1585388783/aggiornamento%20casi%20-%20e%20ricoveri%2028.3%20ore%208.00.pdf.pdf?mobile_stay=1

cassiudders commented 4 years ago

le Marche rilasciano invece tre bollettini diversi ogni giorno:

ogni regione ha il suo schema come vedete

cassiudders commented 4 years ago

qua i morti per provincia che ho raccolto finora: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1v99oT7y-PV9Sy7myZ2_XFmohiOuvAAtN11Onp7ZhTq0/edit?usp=sharing

magaspari commented 4 years ago

Grazie, gran lavoro! Potrebbe essere utile pubblicarli parzialmente per incentivare le altre Regioni a fornirli?

aldogangemi commented 4 years ago

ottimo @cassiudders!

cassiudders commented 4 years ago

un po' per volta aggiungo quello che trovo....ma temo che in Lombardia, che sarebbe la più significativa per delle analisi, non ci siano molte speranze che qualcuno abbia tempo di riportare i dati

dstreppa commented 4 years ago

@cassiudders grazie1000, molto interessante. Una curiostà: come hai fatto a stimare i valori R0 regionali?

cassiudders commented 4 years ago

Una curiostà: come hai fatto a stimare i valori R0 regionali?

cercando di applicare un metodo abbastanza grezzo trovato in rete e ponderandolo per giornate successive per depurarlo degli sbalzi giornalieri: se cercate "LA MATEMATICA SCONFIGGERA' IL VIRUS" di Stefano Tuveri, giornalista (credo) del Sole 24 ore dovreste rintracciare il metodo. in pratica "nuovi contagi giornalieri/nuovi contagi settimanali*7" sarebbe il valore grezzo di R°, con la ponderazione ho dato valori a scalare da 1 a 0,1 agli R° così calcolati giorno x giorno.

non sarà precisissimo ma penso possa bilanciare quei disavanzi che si possono percepire come imputabili al flusso incostante dei dati

magaspari commented 4 years ago

Riguardo ai deceduti il totale del Trentino Alto Adige sembra errato, ovvero molto al di sopra della somma tra le due province .

cassiudders commented 4 years ago

Riguardo ai deceduti il totale del Trentino Alto Adige sembra errato, ovvero molto al di sopra della somma tra le due province .

ok avevo copiato la formula dalla regione precedente. formula corretta. grazie

aledettaale commented 4 years ago

Potrebbe essere utile https://www.arcgis.com/home/webmap/viewer.html?url=https://services1.arcgis.com/XannvQVnsM1hoZyv/ArcGIS/rest/services/TA_COVID19_RL/FeatureServer&source=sd

cassiudders commented 4 years ago

Potrebbe essere utile https://www.arcgis.com/home/webmap/viewer.html?url=https://services1.arcgis.com/XannvQVnsM1hoZyv/ArcGIS/rest/services/TA_COVID19_RL/FeatureServer&source=sd

ottimo! bisogna solo capire come estrarre i dati e poi possono chiudere i buchi nelle serie storiche in Lombardia

downFast commented 4 years ago

Potrebbe essere utile https://www.arcgis.com/home/webmap/viewer.html?url=https://services1.arcgis.com/XannvQVnsM1hoZyv/ArcGIS/rest/services/TA_COVID19_RL/FeatureServer&source=sd

dove hai preso i dati dell'età se posso chiedere?

aledettaale commented 4 years ago

Sono ufficiali della regione. Finché non si accorgono e chiudono l'accesso meglio scaricarli.

Il ven 10 apr 2020, 13:38 downFast notifications@github.com ha scritto:

Potrebbe essere utile https://www.arcgis.com/home/webmap/viewer.html?url=https://services1.arcgis.com/XannvQVnsM1hoZyv/ArcGIS/rest/services/TA_COVID19_RL/FeatureServer&source=sd

dove hai preso i dati dell'età se posso chiedere?

— You are receiving this because you commented. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/pcm-dpc/COVID-19/issues/378#issuecomment-611994119, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AO4VCPZO6TOXHTEA7UVLAW3RL4ALFANCNFSM4LUMXASA .

downFast commented 4 years ago

Sono ufficiali della regione. Finché non si accorgono e chiudono l'accesso meglio scaricarli. Il ven 10 apr 2020, 13:38 downFast notifications@github.com ha scritto: Potrebbe essere utile https://www.arcgis.com/home/webmap/viewer.html?url=https://services1.arcgis.com/XannvQVnsM1hoZyv/ArcGIS/rest/services/TA_COVID19_RL/FeatureServer&source=sd dove hai preso i dati dell'età se posso chiedere? — You are receiving this because you commented. Reply to this email directly, view it on GitHub <#378 (comment)>, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AO4VCPZO6TOXHTEA7UVLAW3RL4ALFANCNFSM4LUMXASA .

hai un link? grazie :)

cassiudders commented 4 years ago

purtroppo arcgis dice che non sono estraibili....se qualcuno di voi ci riesce fate sapere

downFast commented 4 years ago

purtroppo arcgis dice che non sono estraibili....se qualcuno di voi ci riesce fate sapere

ma infatti non capisco come possa aver fatto @aledettaale o da dove provengano, io li ho trovati ma solo nell'infografica giornaliera ma non come dati da prendere senza fare giri di parsing del PDF

cassiudders commented 4 years ago

purtroppo la data di ricezione del tampone non è così utile come lo sarebbe la data di decesso per ricostruire una serie storica, ma a caval donato....

downFast commented 4 years ago

purtroppo la data di ricezione del tampone non è così utile come lo sarebbe la data di decesso per ricostruire una serie storica, ma a caval donato....

si ma se non sono ufficiali e calcolati da noi preferisco non espormi, potrebbe essere abbastanza pericoloso anche

cassiudders commented 4 years ago

purtroppo la data di ricezione del tampone non è così utile come lo sarebbe la data di decesso per ricostruire una serie storica, ma a caval donato....

si ma se non sono ufficiali e calcolati da noi preferisco non espormi, potrebbe essere abbastanza pericoloso anche

addirittura! mica c'è l'anagrafica...comunque uno spunto utile, anche per chi volesse stimare un rate di tamponi positivi

aledettaale commented 4 years ago

Sono ufficiali. Li ho reperiti attraverso il grande lavoro che potete vedere qui https://www.samueleastuti.it/covid-19-dashboard/

cassiudders commented 4 years ago

Sono ufficiali. Li ho reperiti attraverso il grande lavoro che potete vedere qui https://www.samueleastuti.it/covid-19-dashboard/

uso anch'io quel dashboard per calcolarli ogni giorno, prima del 21 marzo purtroppo semplicemente non ci si era pensato

aledettaale commented 4 years ago

In quella dashboard è presente il link indicato https://services1.arcgis.com/XannvQVnsM1hoZyv/ArcGIS/rest/services/TA_COVID19_RL/FeatureServer

downFast commented 4 years ago

purtroppo la data di ricezione del tampone non è così utile come lo sarebbe la data di decesso per ricostruire una serie storica, ma a caval donato....

si ma se non sono ufficiali e calcolati da noi preferisco non espormi, potrebbe essere abbastanza pericoloso anche

addirittura! mica c'è l'anagrafica...comunque uno spunto utile, anche per chi volesse stimare un rate di tamponi positivi

Si addirittura. Uno spunto utile ok ma non li considero affidabili. @aledettaale super, però quello che penso è: perché la protezione civile non li rilascia? Come dici tu @cassiudders non ci sono i nominativi.

downFast commented 4 years ago

In quella dashboard è presente il link indicato https://services1.arcgis.com/XannvQVnsM1hoZyv/ArcGIS/rest/services/TA_COVID19_RL/FeatureServer

Si grazie, stavo proprio guardando li. Ad averli per tutte le regioni...

Lion81 commented 4 years ago

qua i morti per provincia che ho raccolto finora: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1v99oT7y-PV9Sy7myZ2_XFmohiOuvAAtN11Onp7ZhTq0/edit?usp=sharing

@cassiudders ottimo lavoro, ma i dati dei morti per Provincia dove li hai recuperati? Io ho trovato solo i Bollettini giornalieri della Protezione Civile per Regione e il dato dei Casi Totali per Provincia.

Inoltre sarebbe molto utile avere i dati completi dei Bollettini per Provincia come quelli per Regione (con Casi Totali, Tamponi, Guariti, Decessi, Totale attualmente positivi divisi in Isolamento domiciliare, Ricoverati con sintomi e Terapia intensiva). Dubito ci siano, ma qualcuno sa se sono disponibili e nel caso dove si possono recuperare? Grazie

cassiudders commented 4 years ago

regione per regione e giorno dopo giorno coi bollettini ricavabili dai link nello spreadsheet....c'era anche quello della Lombardia, ma l'hanno tolto proprio oggi

Lion81 commented 4 years ago

@cassiudders ho notato che non c è il dato per Provincia di tutte le Regioni, ad esempio mancano Lazio e Campania.. Quindi al momento che voi sappiate non c è un database con anche i Bollettini completi/parziali (almeno morti e tamponi) per Provincia di tutte le Regioni che sia quindi riconciliabile con il Bollettino per Regione?

cassiudders commented 4 years ago

@Lion81 per certe regioni i dati sono così poco organizzati che ho rinunciato.....ho qualche parziale di qualche giorno, ma non esistono fonti ufficiali

cassiudders commented 4 years ago

fra parentesi il consigliere regionale che curava quel dashboard (Samuele Astuti) mi ha dato conferma che la tabella che @aledettaale aveva pescato per i dati in Lombardia è stata eliminata. piano piano stiamo arrivando ai livelli del Turkmenistan -_-

Lion81 commented 4 years ago

Per poter fare analisi e previsioni piu accurate, sarebbe utile avere anche i medesimi dati (per Regione o ancora meglio per Provincia) divisi per età anagrafica, la capacita ospedaliera di posti letto Covid per Ricoverati con sintomi (non terapia intensiva) e la capacità ospedaliera dei posti di terapia intensiva.

Altra informazione che non ho trovato da fonti attendibili è la durata media della malattia dal momento della rilevazione (test positivo) al momento del termine della malattia (morto o guarito). Qualcuno sa se è reperibile? Grazie mille

Lion81 commented 4 years ago

fra parentesi il consigliere regionale che curava quel dashboard (Samuele Astuti) mi ha dato conferma che la tabella che @aledettaale aveva pescato per i dati in Lombardia è stata eliminata. piano piano stiamo arrivando ai livelli del Turkmenistan -_-

Ma questi dati secondo voi non li pubblicano perché non vogliono (magari per non creare allarmismi) o non hanno modo/risorse per rilevarli e organizzarli in tempi utili?

cassiudders commented 4 years ago

@Lion81 citando l'ultima agenzia di Conte, direi che la censura bulgara è un modo abbastanza singolare di curare l'allarmismo della gente XD

Lion81 commented 4 years ago

Non so come la vediate voi, ma a mio avviso l'unico rimedio per isolare il virus e sperare di uscirne a breve era applicare il blocco totale sul modello Whuan da subito in tutta Italia per 1,5-2 mesi. Con il tipo di blocco attuato in Italia non lo isoleremo e, appena riaprono, nell'arco di 1-2 settimane si riavra' un aumento dei casi con crescita esponenziale quasi come prima del blocco (l impatto positivo delle protezioni che attueranno nella Fase 2 secondo me sarà molto limitato, data la tendenza di molti italiani a non rispettare le regole e sottovalutare la gravità della situazione).. Secondo me dove riapriranno a inizio maggio, a giugno dovranno richiudere un altro mese, e il tira e molla andrà avanti finché non si decideranno a fare il Blocco totale alla Whuan.. Questo ritardo nella decisione avrà causato un enorme numero maggiore di morti e di danni economici. Se non si decidono a chiudere tutto veramente per isolare il virus non ne usciremo fino al raggiungimento dell immunità di gregge cje potrebbe essere molto lontano data l elevata mutevolezza del virus..

cassiudders commented 4 years ago

evidentemente oggi come oggi "ricchi e morti" è meglio che "poveri e vivi"....facciamo pure girare l'economia....

Lion81 commented 4 years ago

@Lion81 citando l'ultima agenzia di Conte, direi che la censura bulgara è un modo abbastanza singolare di curare l'allarmismo della gente XD

Scusa non ho inteso, quindi per voi li censurano ma ce li hanno o non hanno modo di organizzare i dati e pubblicarli in tempi utili? Il primo caso mi preoccuperebbe, significherebbe che sanno che la situazione è più grave di quella che stanno facendo intendere tramite i media e, nonostante ciò, parlano di apertura a inizio maggio invece di prolungata o aumentare le restrizioni? Sarebbe assurdo, a meno che non abbiano bisogno di essere legittimati dal dimostrare che riaprendo riaumenteranno i casi e i morti per poi poter chiudere definitivamente tutto e cercare veramente di isolare il virus.. Io avrei bloccato tutto subito come a Whuan (lo dico dal 21 febbraio) ma a questo mondo tutto può essere..

cassiudders commented 4 years ago

la tabella in questione era ben fatta e ben aggiornata tutti i giorni, mi sono accorto dalla tua domanda che è sparita....ieri sera l'hanno aggiornata alle 19, e oggi improvvisamente è sparita nel nulla

Lion81 commented 4 years ago

evidentemente oggi come oggi "ricchi e morti" è meglio che "poveri e vivi"....facciamo pure girare l'economia....

Ok quindi ipotizzi (ma non hai avuto conferma, correggimi se sbaglio) che abbiano i dati ma li censurino, giusto? In tal caso prenderanno una dura batosta dopo due settimane dalla riapertura, perché possono censurare ma fino a un certo punto..puoi fare meno tamponi per rielvare meno casi, ma l intasamento degli ospedali e i morti non li puoi nascondere e non credo arriveranno mai, in un paese cattolico come l Italia, a lasciare morire 1000-2000 persone al giorno facendo finta di niente.. Perché secondo me di questi numeri si parlerà dopo due settimane dalla riapertura di tutte le Regioni.. Si avrà un effetto piu dilazionato nel tempo perché faranno aperture a macchia di leopardo, ma a tendere potrebbe essere così e allora dovranno richiudere tutto..

cassiudders commented 4 years ago

possono censurare finchè vogliono....come vari studi di ISTAT hanno già dimostrato o chiudono anche tutte le anagrafi o le loro figuracce verranno tutte a galla

magaspari commented 4 years ago

Per poter fare analisi e previsioni piu accurate, sarebbe utile avere anche i medesimi dati (per Regione o ancora meglio per Provincia) divisi per età anagrafica, la capacita ospedaliera di posti letto Covid per Ricoverati con sintomi (non terapia intensiva) e la capacità ospedaliera dei posti di terapia intensiva.

Altra informazione che non ho trovato da fonti attendibili è la durata media della malattia dal momento della rilevazione (test positivo) al momento del termine della malattia (morto o guarito). Qualcuno sa se è reperibile? Grazie mille

Penso anche io che servirebbero dati più dettagliati per provincia, con almeno quanto riportato per le regioni. Sarebbe possibile raccoglierli con la stessa metodologia adottata per i decessi?

Per la durata ci sono alcuni studi ad esempio questo molto citato: https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30566-3/fulltext Rimane pero' uno studio sui ricoverati, inoltre il decorso non è completo perché parte dall'ospedalizzazione. Forse c'è qualche review più recente e precisa.

Lion81 commented 4 years ago

Per poter fare analisi e previsioni piu accurate, sarebbe utile avere anche i medesimi dati (per Regione o ancora meglio per Provincia) divisi per età anagrafica, la capacita ospedaliera di posti letto Covid per Ricoverati con sintomi (non terapia intensiva) e la capacità ospedaliera dei posti di terapia intensiva. Altra informazione che non ho trovato da fonti attendibili è la durata media della malattia dal momento della rilevazione (test positivo) al momento del termine della malattia (morto o guarito). Qualcuno sa se è reperibile? Grazie mille

Penso anche io che servirebbero dati più dettagliati per provincia, con almeno quanto riportato per le regioni. Sarebbe possibile raccoglierli con la stessa metodologia adottata per i decessi?

Per la durata ci sono alcuni studi ad esempio questo molto citato: https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30566-3/fulltext Rimane pero' uno studio sui ricoverati, inoltre il decorso non è completo perché parte dall'ospedalizzazione. Forse c'è qualche review più recente e precisa.

@magaspari grazie per link allo studio che è interessante, dal quale mi pare di capire risulti una durata media per i guariti di 22gg e per i morti di 18.5gg. Tuttavia è uno studio fatto su un campione di solo 191 pazienti a Whuan e datato 31 gennaio quando la Cina doveva ancora raggiungere il picco quindi probabilmente le strutture ospedaliere erano ancora ben capienti, sarebbe interessante capire le durate medie della malattia per guariti e morti nelle fasi di sovraccarico/collasso del sistema sanitario, nelle quali presumo la durata per i morti sia significativamente inferiore e per i guariti significativamente superiore.