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pengxingang / Pocket2Mol

Pocket2Mol: Efficient Molecular Sampling Based on 3D Protein Pockets
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TypeError: cannot pickle 'generator' object #25

Open zhangxiaofan-star opened 1 year ago

zhangxiaofan-star commented 1 year ago

您好， 很感谢您的工作，我收获很多。但是我在使用GRK4受体测试的时候，TypeError: cannot pickle 'generator' object这个错误是什么情况呀

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pengxingang commented 1 year ago

你好，你可以看看报错时变量pool的值是否正常；另外你可以尝试使用examples中pdb，看看是否也会出现这个错误。

zhangxiaofan-star commented 1 year ago

好的，谢谢您，我在训练的时候遇到如下报错，torch_geometric中的DataLoader方法定义中我没有看到pin_memory参数，请问这个是什么问题？ 1685108145108

pengxingang commented 1 year ago

你好，根据错误信息SyntaxError应该是语法错误，请检查修改的代码是否有语法错误（例如缩进、逗号等）。torch_geometric的Dataloader是有pin_memory参数的，参见这里，其中kwargs接收pin_memory参数。

zhangxiaofan-star commented 1 year ago

谢谢，这个问题以及解决了，在训练过程中又遇到了如下问题，请问这个要怎么解决呀 image

1685188558647

pengxingang commented 1 year ago

你好，代码经过测试一般不会出现这个问题。不知你是否在哪里做了修改，或是数据文件没有放在正确的位置。你可以通过debug查看出问题时的变量值，或是提供更完整的运行信息。