Closed phil-blain closed 4 years ago
@JFLemieux73
I'm currently running a 5-year gx1 test on daley, will post the results here once it's done.
J'ai tué la job parce que après une heure, j'étais rendu à 10 jours de simulation, à ce rythme il faudrait 182 heures (!) pour faire les 5 ans, le max sur les XC est 3 heures.
Je vais relancer avec plus de procs (la job que j'ai tuée était à 32x1).
C'est quoi la tolérance? C'est peut-être trop stricte pour des long runs...
j'ai mis 20 itérations max pour Picard, le reste c'est les settings que tu avais mis (50 iter pour FGMRES, 5 pour PGMRES, pas de restart pour aucun des deux)
J'ai relancé avec 160 procs (donc 4 noeuds). Il a fait 8 jours puis le modèle s'est arrêté lui-même:
Warning: Departure points out of bounds in remap
my_task, i, j = 56 5 2
dpx, dpy = 21743.4742950987 3.62930107602058
HTN(i,j), HTN(i+1,j) = 19804.4467289214 19655.4102553484
HTE(i,j), HTE(i,j+1) = 58296.6376848263 58334.3602483103
istep1, my_task, iblk = 175386 56 6
Global block: 1000
Global i and j: 74 373
(abort_ice)ABORTED:
(abort_ice) error = (horizontal_remap)ERROR: bad departure points
Je vais comparer les sorties du 32x1 et 160x1...
Normalement quand j'ai eu ce message par le passé c'était lié au nombre de Courant, donc je réduisais le pas de temps.... mais là c'est le solveur implicite donc ça m'étonne...
D'autant plus bizarre que avec 24x1 il s'est rendu à 15 jours, et 32x1 à 10, sans avoir cette erreur au 8e jour... ce qui voudrait dire que les réponses sont différentes en fonction de la décomposition MPI. Je vais investiguer ça avant de continuer les simulation plus longue durée.
@JFLemieux73 bonne nouvelle: j'ai relancé le 160x1 sur daley, et il roule encore, il est rendu à 1 mois et demi de simulation.
Donc surement que l'erreur était causé par les tableaux non initialisés (#34) (j'ai vérifé que le test sur daley n'avait pas été compilé en mode debug, donc il n'initialisait pas les tableaux avec des NaN et donc il utilisait whatever garbage il trouvait dans la mémoire...
Je ne suis pas sur que je vais pouvoir rouler 5 ans par contre en raison de la limite de temps, je vais le laisser rouler et voir combien de temps il fait et ensuite je vais ajuster le nombre de noeuds pour essayer d'accélérer la simulation.
Cool. C'est bien gx1? Si c'est trop long on peut aussi réduire le nb d'itérations de Picard.
Oui, gx1. Ok, je garde en tête pour le nombre d'itér Picard (pour le moment c'est 20, ce qui fait dropper le résiduel environ à 1E-2)
En 3 heures, il a été capable de faire un an et 1/3. J'ai donc relancé une nouvelle job en mettant un an comme temps de simulation et runtype='continue'
, ce qui fait en sorte qu'il va restarter à partir du restart.
Donc on peut compléter les 5 ans facilement en relançant la tâche 3 autres fois ensuite.
J'ai relancé la job qq fois pour compléter les 5 ans.
Le contrôle de qualité passe (vs EVP) sur la grille gx1:
$ ./configuration/scripts/tests/QC/cice.t-test.py ~/data/site4/cice/runs/daley_intel_smoke_gx1_32x1_medium_qc.qc/ ~/data/site4/cice/runs/daley_intel_smoke_gx1_160x1_dynpicard_medium_nonlin20_qc.qc/
INFO:__main__:Running QC test on the following directories:
INFO:__main__: /home/phb001/data/site4/cice/runs/daley_intel_smoke_gx1_32x1_medium_qc.qc/
INFO:__main__: /home/phb001/data/site4/cice/runs/daley_intel_smoke_gx1_160x1_dynpicard_medium_nonlin20_qc.qc/
INFO:__main__:Number of files: 1825
INFO:__main__:2 Stage Test Passed
INFO:__main__:Quadratic Skill Test Passed for Northern Hemisphere
INFO:__main__:Quadratic Skill Test Passed for Southern Hemisphere
INFO:__main__:Creating map of the data (ice_thickness_daley_intel_smoke_gx1_32x1_medium_qc.qc.png)
INFO:__main__:Creating map of the data (ice_thickness_daley_intel_smoke_gx1_160x1_dynpicard_medium_nonlin20_qc.qc.png)
INFO:__main__:Creating map of the data (ice_thickness_daley_intel_smoke_gx1_32x1_medium_qc.qc_minus_daley_intel_smoke_gx1_160x1_dynpicard_medium_nonlin20_qc.qc.png)
INFO:__main__:
INFO:__main__:Quality Control Test PASSED
Différence entre les deux:
Le 30 cm en Antarctique me semble suspect... @JFLemieux73 qu'en penses-tu ?
EVP:
VP:
La différence se situe dans une région ou la glace est très épaisse, donc j'imagine que le 30 cm de différence n'est pas si grave que ça...
Ça me semble ok!
Avec 4 itérations non-linéaires, et la même distribution MPI (160x1), ça a pris 2h15 pour rouler les 5 ans.
did a 5 year test on gx3 and quality control passes when compared to EVP (used 20 nonlinear iterations, default settings for the rest.)
@JFLemieux73 voici l'image générée par le script de contrôle de qualité pour gx3. La légende aide pas ben ben, il faudrait plus de décimale...