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pierrepo / PBxplore

A suite of tools to explore protein structures with Protein Blocks :snake:
https://pbxplore.readthedocs.org/en/latest/
MIT License
28 stars 17 forks source link

Probleme with run_demo1.sh #37

Closed sleonard0386 closed 9 years ago

sleonard0386 commented 9 years ago

Un petit retour de bug de l'étudiant d'Alex sur ce script :

Certaine commande echo ne corresponde pas à la commande lancée réellement exemple : echo "../PBassign.py -f 2LFU.pdb -o 2LFU" puis ../PBassign.py -p 2LFU.pdb -o 2LFU

ou encore

echo "../PBassign.py -d ./ -o all" puis ../PBassign.py -p 3ICH.pdb -p 2LFU.pdb -o several

Enfin, pour la commande permettant de lire un dossier, le retour d'echo n'est pas identique à la commande lancée & la commande lancée renvoie en console 'Nothing to do' : affichage de commande : echo "../PBassign.py -d ./ -o all" & lancement de : ../PBassign.py -p ./ -o all

Voili

PS : comment faire pour lancer la commande sur tous les fichiers d'un dossier sans faire une multitude de -p ou un script externe ?

jbarnoud commented 9 years ago

@Vivi270 A priori ça vient d'être résolu :)