Open pluto-the-lost opened 2 years ago
https://pluto-the-lost.github.io/blogs/2022/06/07/Metabolic-analysis-in-scRNA/#
代谢是细胞内的各种化学反应的总称，用于合成或分解大分子和小分子化合物。这些化合物很多是多肽、脂质、有机酸等，除了维持细胞的营养和能量供应，在信号转导、细胞通讯和转录调控方面都有重要作用。 麻烦的是，代谢物的类别太复杂，现在还没有哪种方法可以一次性把细胞里所有的代谢物都测出来。但另一个方面，代谢反应大多需要酶做催化，酶就是基因的表达产物，而基因表达的转录组是可以测的。那么从基因表达如何推导出代谢物丰度，有了代谢物以后又会带来什么新发现？本文介绍一种使用流平衡分析（flux balance analysis）来做细胞代谢强度推断的方法，再介绍一种用代谢物-受体配对数据库来做细胞通讯的方法。
https://pluto-the-lost.github.io/blogs/2022/06/07/Metabolic-analysis-in-scRNA/#
代谢是细胞内的各种化学反应的总称，用于合成或分解大分子和小分子化合物。这些化合物很多是多肽、脂质、有机酸等，除了维持细胞的营养和能量供应，在信号转导、细胞通讯和转录调控方面都有重要作用。 麻烦的是，代谢物的类别太复杂，现在还没有哪种方法可以一次性把细胞里所有的代谢物都测出来。但另一个方面，代谢反应大多需要酶做催化，酶就是基因的表达产物，而基因表达的转录组是可以测的。那么从基因表达如何推导出代谢物丰度，有了代谢物以后又会带来什么新发现？本文介绍一种使用流平衡分析（flux balance analysis）来做细胞代谢强度推断的方法，再介绍一种用代谢物-受体配对数据库来做细胞通讯的方法。