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About the projection data of Mayo 2016 dataset #7

Open mkxyz-123 opened 8 months ago

mkxyz-123 commented 8 months ago

Hello! I wonder why the size of the projection data is 64x736? Some of the literature I found said that the size of the projection data should be 2304x736. Why does the projection data look so narrow, not like the general projected data that I've seen before. EO7@Y(7(1NZ)CQJ{NJU3SM

mkxyz-123 commented 8 months ago

The general projected data that I've seen before in a literature. MURSM}(A@O76$5PKJAKEK1M

qgao21 commented 8 months ago

Because Mayo 2016 provides spiral CT projection data, while the images you supplied are either fan beam or parallel beam CT projection data. A rebinning operation is necessary to convert the spiral CT data into fan beam geometry for reconstruction using the FBP algorithm.

Each DICOM-CT-PD folder contains a 'txt' file detailing the data specifics, with '64' and '736' representing the detector's rows and columns, respectively, and '2304' indicating the number of projections per rotation. To work with this projection data, you need to explore spiral CT reconstruction algorithms. If you only want to process fan beam projection data, consider utilizing the MIRT or ASTRA toolkits for forward projection.

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mkxyz-123 commented 8 months ago

Because Mayo 2016 provides spiral CT projection data, while the images you supplied are either fan beam or parallel beam CT projection data. A rebinning operation is necessary to convert the spiral CT data into fan beam geometry for reconstruction using the FBP algorithm.

Each DICOM-CT-PD folder contains a 'txt' file detailing the data specifics, with '64' and '736' representing the detector's rows and columns, respectively, and '2304' indicating the number of projections per rotation. To work with this projection data, you need to explore spiral CT reconstruction algorithms. If you only want to process fan beam projection data, consider utilizing the MIRT or ASTRA toolkits for forward projection.

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Thank you soooooo much! You helped me a lot.

123-c1 commented 6 days ago

因为 Mayo 2016 提供螺旋 CT 投影数据,而您提供的图像是扇形光束或平行光束 CT 投影数据。需要重新合并操作,以将螺旋 CT 数据转换为扇形梁几何结构,以便使用 FBP 算法进行重建。

每个 DICOM-CT-PD 文件夹都包含一个“txt”文件,详细说明数据细节,其中“64”和“736”分别代表探测器的行和列,“2304”表示每次旋转的投影次数。要处理这些投影数据,您需要探索螺旋 CT 重建算法。如果您只想处理扇形光束投影数据,请考虑使用 MIRT 或 ASTRA 工具包进行正向投影。

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您好,请问您有将这个螺旋CT投影数据重组为扇形波束投影图像的代码吗,可以分享一下吗,谢谢!!!

mkxyz-123 commented 5 days ago

因为 Mayo 2016 提供螺旋 CT 投影数据,而您提供的图像是扇形光束或平行光束 CT 投影数据。需要重新合并操作,以将螺旋 CT 数据转换为扇形梁几何结构,以便使用 FBP 算法进行重建。 每个 DICOM-CT-PD 文件夹都包含一个“txt”文件,详细说明数据细节,其中“64”和“736”分别代表探测器的行和列,“2304”表示每次旋转的投影次数。要处理这些投影数据,您需要探索螺旋 CT 重建算法。如果您只想处理扇形光束投影数据,请考虑使用 MIRT 或 ASTRA 工具包进行正向投影。

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您好,请问您有将这个螺旋CT投影数据重组为扇形波束投影图像的代码吗,可以分享一下吗,谢谢!!!

你好,这个工作我后续没有跟进了,但是我找到了重排为扇形束的代码:https://github.com/faebstn96/helix2fan

123-c1 commented 4 days ago

因为 Mayo 2016 提供螺旋 CT 投影数据,而您提供的图像是扇形光束或平行光束 CT 投影数据。需要重新合并操作,以将螺旋 CT 数据转换为扇形梁几何结构,以便使用 FBP 算法进行重建。 每个 DICOM-CT-PD 文件夹都包含一个“txt”文件,详细说明数据细节,其中“64”和“736”分别代表探测器的行和列,“2304”表示每次旋转的投影次数。要处理这些投影数据,您需要探索螺旋 CT 重建算法。如果您只想处理扇形光束投影数据,请考虑使用 MIRT 或 ASTRA 工具包进行正向投影。

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您好,请问您有将这个螺旋CT投影数据重组为扇形波束投影图像的代码吗,可以分享一下吗,谢谢!!!

你好,这个工作我后续没有跟进了,但是我找到了重排为扇形束的代码:https://github.com/faebstn96/helix2fan

非常感谢您的回复!但是我用的数据集是https://aapm.app.box.com/s/eaw4jddb53keg1bptavvvd1sf4x3pe9h/folder/144594475090,这个数据集里的螺旋投影用这个代码并没有取得正确的结果,所以我想知道我所用的这个数据集是不是并不适用这个代码?谢谢!

mkxyz-123 commented 4 days ago

因为 Mayo 2016 提供螺旋 CT 投影数据,而您提供的图像是扇形光束或平行光束 CT 投影数据。需要重新合并操作,以将螺旋 CT 数据转换为扇形梁几何结构,以便使用 FBP 算法进行重建。 每个 DICOM-CT-PD 文件夹都包含一个“txt”文件,详细说明数据细节,其中“64”和“736”分别代表探测器的行和列,“2304”表示每次旋转的投影次数。要处理这些投影数据,您需要探索螺旋 CT 重建算法。如果您只想处理扇形光束投影数据,请考虑使用 MIRT 或 ASTRA 工具包进行正向投影。

图像

您好,请问您有将这个螺旋CT投影数据重组为扇形波束投影图像的代码吗,可以分享一下吗,谢谢!!!

你好,这个工作我后续没有跟进了,但是我找到了重排为扇形束的代码:https://github.com/faebstn96/helix2fan

非常感谢您的回复!但是我用的数据集是https://aapm.app.box.com/s/eaw4jddb53keg1bptavvvd1sf4x3pe9h/folder/144594475090,这个数据集里的螺旋投影用这个代码并没有取得正确的结果,所以我想知道我所用的这个数据集是不是并不适用这个代码?谢谢!

不好意思,这个我也不知道了,低剂量CT这个课题我后续没有再做了