Скопировал Jedi в корень. Теперь можно просто php jedi env:init default
Включил режим автоматического создания миграций (без него совсем трудно).
Добавил пример консольной команды jedi: создает симлинки на bitrix, local, upload. upload пришлось добавить в гит, чтобы симлинк создался без проблем. И добавил туда стандартный битриксовский .htaccess
php jedi env:init defaultbitrix,local,upload.uploadпришлось добавить в гит, чтобы симлинк создался без проблем. И добавил туда стандартный битриксовский.htaccess