type of infile

[Vik-1]

Hi there, I am trying to use this code calculate onset and demise in a model data. I am actually new to python coding. I got particularly confused on the type of dataset used in the calculation. Having seen "list.CPC_UNI.txt" and I have netcdf file as input data. Can you please give further guidance on how to use netcdf file with this code.

Thanks

[rjbombardi]

Hi, I’m with limited internet access this week.

I usually create a list of input files “listCPC_UNI.txt” to read the precipitation files. It is just a list of file names including their path. You can read them in whatever way you prefer.

Python has a pretty straightforward NetCDF library.

As long as you create a numpy array with dimensions [time, lat, lon] it should work.

I can help you with that next week if you want

Best Rodrigo

On Mon, Dec 7, 2020 at 3:11 AM Vik-1 notifications@github.com wrote:

Hi there, I am trying to use this code calculate onset and demise in a model data. I am actually new to python coding. I got particularly confused on the type of dataset used in the calculation. Having seen "list.CPC_UNI.txt" and I have netcdf file as input data. Can you please give further guidance on how to use netcdf file with this code.

Thanks

— You are receiving this because you are subscribed to this thread. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/rjbombardi/onset_demise_rainy_season/issues/1, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AEB65R6V2EFE37IMBT67PK3STSL2PANCNFSM4UQE2VUA .

-- Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

[Vik-1]

Hello Rodrigo, thanks for your quick response and the information. I look forward to more help from you next week. Thanks again.

[rjbombardi]

Hi,

Here is an example of reading data from MERRA-2 NetCDF files. All you need to do is replace lines 219 to 249 in ranyseason.py by something like the lines at the end of this message. The file 'list.MERRA2.prec.txt' is a list of file names (and their complete path). In linux, I create this list using "ls -1 /path/files > list.MERRA2.prec.txt" You don't have to do it this way. You can read the files straight from python without having to generate a list of files. I just prefer this way. Note that in this case I am reading two different variables and combining them (large-scale precipitation and convective precipitation).

The part you are interested in is:

from netCDF4 import Dataset dataset = Dataset(filename)

From this you can extract whatever information you want.

If you simply type "dataset.variables" you will see a lot of information such as variable names and their dimensions. Then you can extract them for example: lons=dataset.variables['lon'][:] (that gives you a vector of longitudes; something like lons=dataset.variables['lon'][0:100] would return the first 100 values of longitude). If you have multiple dimensions you can extract a subset as long as you know the indices and the order of dimensions.

In my case, I have one file for each day. Let me know roughly the number of files, the dimensions of each files, and the units, and I can give you a more precise code.

Best,

Reading list of files

pathin='/home/rodrigo/python_programs/RADS/' pathout='/home/rodrigo/subsets/' file1='list.MERRA2.prec.txt' filein=pathin+file1

files = [] fp = open(filein,'r') for line in fp: line = line.strip() files.append(line)

fp.close()

ntot=len(files)

from netCDF4 import Dataset dataset = Dataset(files[0])

lats=dataset.variables['lat'][:] lons=dataset.variables['lon'][:]

nlon=lons.size nlat=lats.size tot=365

Reading precipitation

print('reading data...') prec=np.zeros((ntot,nlat,nlon))

reading all files

for nt in range(0,ntot): from netCDF4 import Dataset dataset = Dataset(files[nt]) tmp=dataset.variables['PRECCUCORR'][0,:,:] tmp2=dataset.variables['PRECLSCORR'][0,:,:] prec[nt,:,:]=86400.*(tmp[:,:]+tmp2[:,:])

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Mon, Dec 7, 2020 at 9:20 PM Vik-1 notifications@github.com wrote:

Hello Rodrigo, thanks for your quick response and the information. I look forward to more help from you next week. Thanks again.

— You are receiving this because you commented. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/rjbombardi/onset_demise_rainy_season/issues/1#issuecomment-740347997, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AEB65R5G3FRLNGBR75BL2O3STWLPLANCNFSM4UQE2VUA .

[Vik-1]

Thank you for your help, I have been able to read the file successfully. I intend to use CMIP6 dataset for this calculation. Before then , I am trying to reproduce your output using CPC data. I got this error.

Data read. reading data... data read Formating data... Formatting Data... Traceback (most recent call last): File "rainyseason.py", line 278, in jday=np.delete(jday,id,axis=0) NameError: name 'jday' is not defined

[ibrahimsalifou]

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

[rjbombardi]

[traduit avec google traduction] Bonjour, Si vous m'envoyez votre jeu de données, je pourrais peut-être le calculer pour vous. Je suis assez occupé en ce moment donc cela peut me prendre un certain temps. Selon le format des données, je pourrais le faire en quelques jours ou quelques mois. Merci, Rodrigo

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 4:56 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

— You are receiving this because you commented. Reply to this email directly, view it on GitHub https://github.com/rjbombardi/onset_demise_rainy_season/issues/1#issuecomment-981168352, or unsubscribe https://github.com/notifications/unsubscribe-auth/AEB65R3JZKHFZIBT7EE3IGDUOKXRJANCNFSM4UQE2VUA . Triage notifications on the go with GitHub Mobile for iOS https://apps.apple.com/app/apple-store/id1477376905?ct=notification-email&mt=8&pt=524675 or Android https://play.google.com/store/apps/details?id=com.github.android&referrer=utm_campaign%3Dnotification-email%26utm_medium%3Demail%26utm_source%3Dgithub.

[ibrahimsalifou]

Merci  Docteur, d'avoir répondu à ma préoccupation.ci-joint les données d'étude.Bonne réception,bien cordialement  ibrahim Salifou On Sunday, November 28, 2021, 11:08:24 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

[traduit avec google traduction] Bonjour, Si vous m'envoyez votre jeu de données, je pourrais peut-être le calculer pour vous. Je suis assez occupé en ce moment donc cela peut me prendre un certain temps. Selon le format des données, je pourrais le faire en quelques jours ou quelques mois. Merci, Rodrigo

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 4:56 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

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[rjbombardi]

Je n'ai pas reçu les données. Veuillez envoyer à @.***

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 5:40 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Merci Docteur, d'avoir répondu à ma préoccupation.ci-joint les données d'étude.Bonne réception,bien cordialement ibrahim Salifou On Sunday, November 28, 2021, 11:08:24 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

[traduit avec google traduction] Bonjour, Si vous m'envoyez votre jeu de données, je pourrais peut-être le calculer pour vous. Je suis assez occupé en ce moment donc cela peut me prendre un certain temps. Selon le format des données, je pourrais le faire en quelques jours ou quelques mois. Merci, Rodrigo

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 4:56 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

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[ibrahimsalifou]

On Monday, November 29, 2021, 02:15:11 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi ***@***.***> wrote:  

Je n'ai pas reçu les données. Veuillez envoyer à @.***

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On Sun, Nov 28, 2021 at 5:40 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Merci Docteur, d'avoir répondu à ma préoccupation.ci-joint les données d'étude.Bonne réception,bien cordialement ibrahim Salifou On Sunday, November 28, 2021, 11:08:24 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

[traduit avec google traduction] Bonjour, Si vous m'envoyez votre jeu de données, je pourrais peut-être le calculer pour vous. Je suis assez occupé en ce moment donc cela peut me prendre un certain temps. Selon le format des données, je pourrais le faire en quelques jours ou quelques mois. Merci, Rodrigo

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 4:56 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

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[ibrahimsalifou]

Bonsoir Docteur, ci-joint les données d'étude. On Monday, November 29, 2021, 03:13:05 PM UTC, IBRAHIM SALIFOU @.***> wrote:

On Monday, November 29, 2021, 02:15:11 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi ***@***.***> wrote:  

Je n'ai pas reçu les données. Veuillez envoyer à @.***

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 5:40 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Merci Docteur, d'avoir répondu à ma préoccupation.ci-joint les données d'étude.Bonne réception,bien cordialement ibrahim Salifou On Sunday, November 28, 2021, 11:08:24 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

[traduit avec google traduction] Bonjour, Si vous m'envoyez votre jeu de données, je pourrais peut-être le calculer pour vous. Je suis assez occupé en ce moment donc cela peut me prendre un certain temps. Selon le format des données, je pourrais le faire en quelques jours ou quelques mois. Merci, Rodrigo

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 4:56 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

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[rjbombardi]

Pourriez-vous s'il vous plaît m'envoyer un e-mail à partir de votre adresse e-mail professionnelle à rjbombardi à tamu dot edu ?

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Mon, Nov 29, 2021 at 9:55 AM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonsoir Docteur, ci-joint les données d'étude. On Monday, November 29, 2021, 03:13:05 PM UTC, IBRAHIM SALIFOU @.***> wrote:

On Monday, November 29, 2021, 02:15:11 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

Je n'ai pas reçu les données. Veuillez envoyer à @.***

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 5:40 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Merci Docteur, d'avoir répondu à ma préoccupation.ci-joint les données d'étude.Bonne réception,bien cordialement ibrahim Salifou On Sunday, November 28, 2021, 11:08:24 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

[traduit avec google traduction] Bonjour, Si vous m'envoyez votre jeu de données, je pourrais peut-être le calculer pour vous. Je suis assez occupé en ce moment donc cela peut me prendre un certain temps. Selon le format des données, je pourrais le faire en quelques jours ou quelques mois. Merci, Rodrigo

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 4:56 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

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[ibrahimsalifou]

j'ai un seul email : @. On Tuesday, November 30, 2021, 03:06:49 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.> wrote:

Pourriez-vous s'il vous plaît m'envoyer un e-mail à partir de votre adresse e-mail professionnelle à rjbombardi à tamu dot edu ?

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Mon, Nov 29, 2021 at 9:55 AM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonsoir Docteur, ci-joint les données d'étude. On Monday, November 29, 2021, 03:13:05 PM UTC, IBRAHIM SALIFOU @.***> wrote:

On Monday, November 29, 2021, 02:15:11 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

Je n'ai pas reçu les données. Veuillez envoyer à @.***

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 5:40 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Merci Docteur, d'avoir répondu à ma préoccupation.ci-joint les données d'étude.Bonne réception,bien cordialement ibrahim Salifou On Sunday, November 28, 2021, 11:08:24 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

[traduit avec google traduction] Bonjour, Si vous m'envoyez votre jeu de données, je pourrais peut-être le calculer pour vous. Je suis assez occupé en ce moment donc cela peut me prendre un certain temps. Selon le format des données, je pourrais le faire en quelques jours ou quelques mois. Merci, Rodrigo

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 4:56 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

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[rjbombardi]

Je ne peux pas voir votre e-mail car GitHub le cache. Je ne peux pas vous aider si vous continuez à m'envoyer des messages via GitHub

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Tue, Nov 30, 2021 at 9:34 AM ibrahimsalifou @.***> wrote:

j'ai un seul email : @. On Tuesday, November 30, 2021, 03:06:49 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.> wrote:

Pourriez-vous s'il vous plaît m'envoyer un e-mail à partir de votre adresse e-mail professionnelle à rjbombardi à tamu dot edu ?

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Mon, Nov 29, 2021 at 9:55 AM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonsoir Docteur, ci-joint les données d'étude. On Monday, November 29, 2021, 03:13:05 PM UTC, IBRAHIM SALIFOU @.***> wrote:

On Monday, November 29, 2021, 02:15:11 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

Je n'ai pas reçu les données. Veuillez envoyer à @.***

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 5:40 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Merci Docteur, d'avoir répondu à ma préoccupation.ci-joint les données d'étude.Bonne réception,bien cordialement ibrahim Salifou On Sunday, November 28, 2021, 11:08:24 PM UTC, Rodrigo J. Bombardi @.***> wrote:

[traduit avec google traduction] Bonjour, Si vous m'envoyez votre jeu de données, je pourrais peut-être le calculer pour vous. Je suis assez occupé en ce moment donc cela peut me prendre un certain temps. Selon le format des données, je pourrais le faire en quelques jours ou quelques mois. Merci, Rodrigo

Rodrigo J. Bombardi Assistant Professor Department of Geography, Texas A&M University 3147 TAMU | College Station, TX 77843-3147. MS 3147

On Sun, Nov 28, 2021 at 4:56 PM ibrahimsalifou @.***> wrote:

Bonjour Docteur, j'ai un jeu de données de 51 ans uniquement les données de précipitations au pas de temps de journalier. je veux déterminer le début et la fin de la saison pluvieuse pour chaque année. j'ai voulu votre code, mais je constate que vous n'avez pas utilisé le même fichier que moi, et je n'arrive pas également à adapter le code ma guise vu que je suis nouveau en programmation. je sollicite votre aide pour pouvoir effectuer ce travail. dans l'attente d'une suite favorable, recevez mes meilleures salutations. ibrahim salifou

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