Erweiterung AMELAG-Datenschema - Githubissues

robert-koch-institut / Abwassersurveillance_AMELAG

Das Vorhaben „Abwassermonitoring für die epidemiologische Lagebewertung“ (AMELAG) läuft vom 22.11.2022 bis zum 31.12.2024. Behörden, Kläranlagen und Labore arbeiten zusammen, um Proben zu nehmen, zu analysieren und zu bewerten. Das Ziel dieses Vorhabens ist es, SARS-CoV-2-Nachweise aus dem Abwasser als zusätzlichen Indikator zur epidemiologische...

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Erweiterung AMELAG-Datenschema #7

Closed SimonScholler closed 3 weeks ago

SimonScholler commented 3 weeks ago

Konkret werden in den beiden Datensatz-Files neue Spalten hinzugefügt.

An die Datei amelag_einzelstandorte.tsv werden folgende Spalten hinzugefügt:

normalisierung: Definiert, ob die Messwerte (nach Durchfluss) normalisiert wurden. Mögliche Werte sind ja, nein, NA
typ: Definiert den gemessenen Virustyp. Mögliche Werte sind Influenza-A, Influenza-B, Influenza-Gesamt, SARS-CoV-2.
unter_bg: definiert ob ein Messwert unterhalb der Bestimmungsgrenze liegt. Mögliche Werte sind ja, nein, NA

An die Datei amelag_aggregierte_kurve.tsv werden folgende Spalten hinzugefügt:

normalisierung: Definiert, ob die Messwerte (nach Durchfluss) normalisiert wurden. Mögliche Werte sind ja, nein, NA
typ: Definiert den gemessenen Virustyp. Mögliche Werte sind Influenza-A, Influenza-B, Influenza-Gesamt, SARS-CoV-2.