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robert-koch-institut / SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland

Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruie...
https://robert-koch-institut.github.io/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/
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Fehlende Sequenzdaten (csv/fasta) Uploads ab 2022-08-31 #34

Closed icestorm972 closed 1 year ago

icestorm972 commented 1 year ago

Guten Morgen,

Zur Info, es scheint wieder Pipeline-Probleme im Nachtlauf (Sequenzen, ~21:30) zu geben.

Der letzte Commit mit "SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.csv.xz", "SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz" (plus zugehöriger ".zenodo.json") war am 30. August.

Viele Grüße, David

Siehe auch https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/issues/29

cuehs commented 1 year ago

Hi @icestorm972 das Problem ist uns bekannt und wir versuchen es so schnell wie möglich zu beheben.

icestorm972 commented 1 year ago

Es kommen zwar wieder Updates mit ein paar 100 Sequenzdaten, aber es scheinen viele Sequenzdaten seit 31.08. zu fehlen? Figure 2022-09-05 072115

cuehs commented 1 year ago

Die fehlenden Sequenzen sollten heute Abend verarbeitet und bereitgestellt werden.

icestorm972 commented 1 year ago

Figure 2022-09-08 073526 Das Update heute Nacht sah gut aus bzgl Nachmeldungen der Ausfälle letzter Woche und von vorgestern 😊

cuehs commented 1 year ago

Dann mach ich mal zu.