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robert-koch-institut / SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland

Ein zentraler Bestandteil einer erfolgreichen Erregersurveillance ist das Verständnis der Verbreitung eines Erregers sowie seiner pathogenen Eigenschaften. Hierbei stellt das Wissen über das Erregergenom eine wichtige Informationsquelle dar. So erlaubt der Nachweis von Mutationen im Genom eines Erregers, Verwandtschaftsbeziehungen zu rekonstruie...
https://robert-koch-institut.github.io/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/
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Fehlende Sequenzdaten (csv/fasta) Uploads ab 2022-09-19 #36

Closed icestorm972 closed 1 year ago

icestorm972 commented 1 year ago

Hi,

zur Info: seit 2 Tagen gibt es nachts keine SARS-CoV-2-Sequenzdaten_Deutschland.fasta.xz / *.csv.xz Uploads mehr (auch kein zenodo Metadata, analog https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/issues/34).

Viele Grüße David

P.S. Hat der Fix von https://github.com/robert-koch-institut/SARS-CoV-2-Sequenzdaten_aus_Deutschland/issues/35 vielleicht damit was zu tun, oder nur zufällig zeitgleich?

cuehs commented 1 year ago

@cuehs

HannesWuensche commented 1 year ago

Hallo @icestorm972,

wir haben gerade die Sequenzdaten von gestern bereitgestellt. Wir hoffen alle Fehler sind beseitigt und ab heute Abend alle Datenbereitstellungen wieder in der gewohnten Regelmäßigkeit. Allgemein: Beide Pipelines greifen auf die gleichen Rohdaten zu, arbeiten aber insgesamt unabhängig voneinander.

Mit besten Grüße @HannesWuensche für das Team RKI | Open Data

icestorm972 commented 1 year ago

Alles klar, Danke! 😊