robinandeer / cosmid

Genomics database manager
MIT License
25 stars 3 forks source link

More resources #30

Open robinandeer opened 10 years ago

robinandeer commented 10 years ago

Stödjer cosmid annat än ftp nedladdnigar?

Jag skulle behöva kunna tanka ner följande filer via cosmid till MIP och visa är riktigt stora:

http://evs.gs.washington.edu/evs_bulk_data/ESP6500SI-V2-SSA137.protein-hgvs-update.snps_indels.vcf.tar.gz

http://dbnsfp.houstonbioinformatics.org/dbNSFPzip/dbNSFPv2.4.zip

http://krishna.gs.washington.edu/download/CADD/v1.0/whole_genome_SNVs.tsv.gz http://krishna.gs.washington.edu/download/CADD/v1.0/whole_genome_SNVs.tsv.gz.tbi

http://krishna.gs.washington.edu/download/CADD/v1.0/1000G.tsv.gz http://krishna.gs.washington.edu/download/CADD/v1.0/1000G.tsv.gz.tbi

henrikstranneheim commented 10 years ago

Vore bra om CLINVAR kunde inkluderas också t.ex. ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/clinvar/vcf_GRCh37/clinvar_20140902.vcf