search

ruanjue / wtdbg2

Redbean: A fuzzy Bruijn graph approach to long noisy reads assembly
GNU General Public License v3.0
513 stars 94 forks source link

是否支持集群 #135

Closed focusjava closed 5 years ago

focusjava commented 5 years ago

您的这款工具是否支持集群操作？例如SGE集群，Falcon和Canu都支持SGE集群计算，希望得到您的回复信息，谢谢！

ruanjue commented 5 years ago

Redbean没有开发集群版本，我们的目标是使用单个节点一天内完成人类基因组组装，所以没有花费精力来开发多节点并行版本。

focusjava commented 5 years ago

非常感谢收到您的回复，另外问一下，您说的使用单个节点一天内完成人类基因组组装，所需要的服务器配置资源是怎样的？CPU，内存，硬盘存储？谢谢！

ruanjue commented 5 years ago

RAM >= 256 GB DISK >= 1 TB CPU >= 48 cores