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ryought / dbgphmm

Probabilistic genome assembler based on de Bruijn Graph and profile HMM
https://ryought.github.io/dbgphmm/dbgphmm/
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Feat/accept multi neighbors #178

Closed ryought closed 1 year ago

ryought commented 1 year ago

rescue neighborをsampleした後、同時に複数個のupdateを採用するようにした(スコアが向上するもので、独立なもの)

問題点： high copyなものはよく採用されがち。 10x〜20xみたいなやつを通るサイクルはよく出てくる。 ちょこちょこ動かすようなものは採用しても良いかもしれない。