santashen / windsong-comments

1 stars 0 forks source link

分子模拟技术栈 #451

Open santashen opened 6 months ago

santashen commented 6 months ago

https://www.windsong.top/%E5%88%86%E5%AD%90%E6%A8%A1%E6%8B%9F%E6%8A%80%E6%9C%AF%E6%A0%88/

分子模拟技术栈

学习参考 .."LAMMPS data文件创建工具--moltemplate", Roy Kid

gaussview 绘制基本小分子,导出pdb文件 packmol 导入上一步的pdb文件,进行空间排布,导出系统的pdb文件 moltemplate 导入系统的pdb文件,同时提供力场信息,生成lammps模拟所需的data文件和力场文件 lammps 模拟