Spotting height

[sanekun]

dest.bottom(z=4) touch tip 필요 없음

{ "Plates": { "DNA_plate_0_name": { "data": { "A1": "pACBB_4-5", "C1": "pET-28a(+)", "A2": "pACBB_4-5_T7pad FWD", "B2": "pACBB_T7-F1", "C2": "pET-28a(+) FWD", "A3": "pACBB_vec-R2", "B3": "pACBB_4-5_T7pad REV", "C3": "pET-28a(+) REV" }, "labware": "biorad_96_wellplate_200ul_pcr", "type": "DNA" }, "Reaction_plate_0_name": { "data": { "F1": "G1", "G1": "G2", "H1": "G3", "F4": "Phusion", "G4": "HiFi" }, "labware": "biorad_96_wellplate_200ul_pcr", "type": "Reaction" }, "TF_plate_0_name": { "data": { "A1": "Phusion", "B1": "Phusion", "E1": "HiFi", "F1": "HiFi", "A2": "Phusion", "B2": "Phusion", "E2": "HiFi", "F2": "HiFi", "A3": "Phusion", "B3": "Phusion", "E3": "HiFi", "F3": "HiFi", "A4": "Phusion", "B4": "Phusion", "E4": "HiFi", "F4": "HiFi", "A5": "Phusion", "B5": "Phusion", "E5": "HiFi", "F5": "HiFi", "A6": "Phusion", "B6": "Phusion", "E6": "HiFi", "F6": "HiFi" }, "labware": "biorad_96_wellplate_200ul_pcr", "type": "TF" } }, "Reactions": { "PCR_plate_0_name": { "data": { "Name": { "0": "G1", "1": "G2", "2": "G3" }, "DNA1": { "0": "pACBB_4-5", "1": "pACBB_4-5", "2": "pET-28a(+)" }, "DNA2": { "0": "pACBB_4-5_T7pad FWD", "1": "pACBB_T7-F1", "2": "pET-28a(+) FWD" }, "DNA3": { "0": "pACBB_vec-R2", "1": "pACBB_4-5_T7pad REV", "2": "pET-28a(+) REV" }, "Enzyme1": { "0": "PCRMix", "1": "PCRMix", "2": "PCRMix" }, "DW": { "0": "DW", "1": "DW", "2": "DW" } }, "type": "PCR" }, "Assembly_plate_0_name": { "data": { "Name": { "0": "Phusion", "1": "HiFi" }, "DNA1": { "0": "G1", "1": "G1" }, "DNA2": { "0": "G2", "1": "G2" }, "DNA3": { "0": "G3", "1": "G3" }, "Enzyme1": { "0": "HotPhusion", "1": "NEBHiFi" }, "DW": { "0": "DW", "1": "DW" } }, "type": "Assembly" } }, "Reaction_volume": { "PCR": { "DNA1": "0.5", "DNA2": "0.4", "DNA3": "0.4", "Enzyme1": "12.5", "DW": "10" }, "Assembly": { "DNA1": "1", "DNA2": "1", "DNA3": "1", "Enzyme1": "10", "DW": "8" } }, "Parameters": { "Number of Plate": 3, "Plate_type": [ "DNA", "Reaction", "TF" ], "Reaction_type": [ "PCR", "Assembly" ], "Enzyme_position": { "HotPhusion": "A1", "NEBHiFi": "A2", "PCRMix": "A3", "DW": "A4", "CPcell": "B1", "LB": "B2" }, "Deck_position": { "Enzyme_tube": 1, "p20_tip": 2, "p300_tip": 3, "DNA_plate_0_name": 4, "Reaction_plate_0_name": 7, "TF_plate_0_name": 5 }, "number_of_tips": null } }

[sanekun]

pipette.mix 시 picked_tip이 없어도 작동하는 지 확인 -> 작동 안함

[sanekun]

231229 실제 테스트

• [x] DW 분주 시 Mix & Touch tip & blow_out 삭제
• [x] Assembly 단계 PCR product를 딸 때 속도줄임, Blow_out 필요 (Enzyme 취급)
• [x] CP cell 분주 전 매번 mix 하던거 한번으로 변경
• [x] CP cell 분주 후 mix_after
• [x] LB, CP cell 따는 위치 살짝 올리기(z=3)
• [x] thermocycler deactivate -> Recovery transfer -> temperature(37) (온도가 변하는 시간 동안 동작이 정지됨)
• [x] Spotting 에 touch tip 삭제

[sanekun]

DNA dispense 시간 줄이기

DNA 다넣고 Mix 시간 줄이기 PCR blow_out 빼기 컴셀 넣고 믹스하는 시간 줄이기

[sanekun]

Recovery 할 때 Lid deactivation

[sanekun]

Spotting 직전 Cell mix하기