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[PubMed] XML está sendo gerado com afiliações faltando #3324

Closed JoyceRaphaela closed 4 years ago

JoyceRaphaela commented 4 years ago

Ao gerar o XML para envio ao PubMed verificamos que quando há presença de mais de uma afiliação ligada a um autor somente uma afiliação é gerada, sendo que as outras afiliações ligadas a esse autor são excluídas do XML, conforme exemplificado nas imagens abaixo:

XML do artigo:

michele affmichele

XML gerado para o PubMed:

michelepubmed

Arquivos referentes ao artigo utilizado como exemplo: 1678-8060-mioc-115-e200225.zip V:\SciELO\serial\mioc\v115\lote 5520\1678-8060-mioc-115-55

XML gerado para envio ao PubMed: miocv11520200814-20200815.zip Y:\SciELO_team\Núcleo de Publicação\FLUXO\ENVIO DE BASES ISI E PUBMED\Envio_Bases\PUBMED\2020\Agosto\19-08-2020\PubMed

JoyceRaphaela commented 4 years ago

Segue link para o acesso ao Guia do PubMed: https://docs.google.com/document/d/1VGj4Bw-2LzO6T8hECA9DqDYei2Pp104Bm43H_STDrVo/edit#heading=h.2tla8xyho2tp

robertatakenaka commented 4 years ago

Após inserir algumas mensagens ("print") no script src/scielo/bin/xml/app_modules/tools4dsk/xml_pubmed.py, o problema não voltou a aparecer e não conseguimos identificar o problema. Talvez ao incluir print, o script demorou um pouco mais para terminar de executar e isso favoreceu com que a geração do XML completasse com sucesso.

Nota: Originalmente o script de geração do XML do PubMed, usava a base de dados ISIS e outra XSL. Com as novas demandas e para tomar proveito do XML SPS, foram feitas melhorias no script. A nova versão do script não excluiu a geração do XML da forma antiga (base de dados ISIS). A forma nova sobrescreve o XML gerado pela versão antiga.

Por algum motivo, o xml_pubmed.py (forma nova), não estava gerando o XML, então, a versão antiga era visualizada, com os defeitos comentados neste issue.

gustavofonseca commented 4 years ago

@robertatakenaka, este ticket pode ser fechado?