Podobne programy - Githubissues

sh-miR / designer

sh-miR Designer is a software aimed for fast and efficient design of effective RNA interference (RNAi) reagents - sh-miRs, also known as artificial miRNAs.

6 stars 4 forks source link

Podobne programy #1

Closed Nozdi closed 10 years ago

Nozdi commented 11 years ago

Dotyczące sh-mir, lub mirna mimetic. Bez wzgledu na jezyk programowania i organizmy.

rglsk commented 11 years ago

Mima simulator:

wszystko spoko okej ale po niemiecku
i nie wiem czy o to chodzi, najlepiej check up dla Marytny :)
http://www.markuswestphal.de/mima/

rglsk commented 11 years ago

RNA and proteins:

Ładna stronka z wielkoma opcjami podyfikacji RNA, DNA i białka
Duży minus, gdyż jest to płatny sofware i za bardzo nie ma jak go przetestować
http://www.clcbio.com/products/clc-main-workbench/

rglsk commented 11 years ago

Stronka zawierająca servery i struktury RNA, można wprowadzać własne struktury i sprawdzać w bazie:

http://rna.tbi.univie.ac.at/

ghost commented 11 years ago

ok, płatnych nie bierzemy bo to zwykle wiąże się jeszcze z prawami autorskimi itd. Mima simulator ->wtf? nie o to chodzi. MIRNA z tej trzeciej strony możemy zobaczyć RNAfold i zobaczyć czy łatwiej wykorzystamy to czy mfold Przykład podobnego programu: http://wmd3.weigelworld.org/cgi-bin/webapp.cgi

to może się przydać do walidacji reagnetów: http://gencomp.bio.unipd.it/magia/start/ (czy działają specyficznie)

ghost commented 11 years ago

ten program który podesłałam zwrócił mi wynik po 3 dniach :), więc nasz będzie działał szybciej.