sh-miR / designer

sh-miR Designer is a software aimed for fast and efficient design of effective RNA interference (RNAi) reagents - sh-miRs, also known as artificial miRNAs.
6 stars 4 forks source link

Sprawdzenie off-targetu wstawki (jednej i drugiej nitki) #53

Closed ghost closed 9 years ago

ghost commented 10 years ago

Porównanie sekwencji czasteczek miRNA (sens i antysens) z sekwencjami zgromadzonymi w bazie ref mRNA aby ocenic czy ta czasteczka ma szanse oddzialywac z innymi transkryptami. Dopuszczamy do 4 mismatchy (czyli niesparowan – funkcjonalnosc blasta)