sh-miR / designer

sh-miR Designer is a software aimed for fast and efficient design of effective RNA interference (RNAi) reagents - sh-miRs, also known as artificial miRNAs.
6 stars 4 forks source link

[FILIZOFIA] Zastanówcie się czy przenieść designera do api #54

Closed sylwekb closed 10 years ago

sylwekb commented 10 years ago

+bedzie mozna przechowywac ostatnio wykonywane zapytania o sh-miry (ala cache) i zwracać jeśli istnieją. +łatwość obsługi z zewnątrz. Można nawet curlem polecieć -trzeba przepisać api na python2, bo biopython jest niestabilny dla py3

nhlfr commented 10 years ago

Przepisanie na Py2 nie będzie wielkim problemem - kwestia wklepania unicode_literals i prawdopodobnie zmiany w config parserze. Nic więcej.

Kiedyś argumentem za izolowaniem designera od api był brak zależność designera od innych bibliotek pythonowych, tak żeby działał z samymi bibliotekami standardowymi. Ale to już nieaktualne, co nie?