search

shpratama / nanocaffeine

sra's estilu
0 stars 0 forks source link

Simulation software #2

Open dudung opened 1 year ago

dudung commented 1 year ago

Sore Pak, berikut simulasi yg dpt digunakan untuk interaksi biomolekul. Keduanya berbasis MD Pak...

Gaussian accelerated MD: http://miaolab.org/GaMD/ Coarse-grained Martini: http://cgmartini.nl/

Originally posted by @shpratama in https://github.com/shpratama/nanocaffeine/issues/1#issuecomment-1294846504

dudung commented 1 year ago

@shpratama tolong ditelusuri lebih lanjut, ya.

Saya melihat bahwa GaMD itu tidak berjalan sendiri melainkan perlu menggunakan salah satu dari

Dan untuk Martini kelihatannya merupakan bagian dari:

sebagaimana terbaca dalam diskusi ini.

shpratama commented 1 year ago

Wah iya, baik Pak. Terlewat oleh sy. Hatur nuhun Pak...

dudung commented 1 year ago

Wah iya, baik Pak. Terlewat oleh sy. Hatur nuhun Pak...

Tolong dipastikan dan bila ya, kita perlu mulai belajar dari menginstalnya terlebih dahulu. Apakah akan menggunakan fasilitas di PPNN? Atau cukup komputer sendiri atau di Lab Pak Suprijadi?