並列化への対応

[soh-i]

seq.pyにおいて、染色体毎に与えられたfastaファイルを分割してpysamオブジェクトを生成するところまでを書いた。

なるべく、既存のクラスに変更を加えることなく、並列化に対応させる。

[soh-i]

• ブロックにゲノムを分割して、任意のスレッドを生成する部分は動いていることを確認した。https://github.com/soh-i/Ivy/blob/pileup/src/Ivy/run_ivy.py#L45-91 らへん。:beer:++
• 後は、並列させた場合に、AttrDictのparam argsにわたす染色体名を解决するのと、スレッド毎の計算結果をマージするメソッドを定義しておく。
• ベンチマークは必ずとり、何倍高速化したのかを評価する。