Która wersja daje poprawne wyniki?

[mklew]

Wersja rekurencyjna - można zauważyć, że ona nie wstawia przerw do najdłuższej sekwencji

GCTGTCGACGGATTCGGGGTGGC
-CG-AAA----------------
CTC-GAG--GGC--GGCGGCGGT
Alignment: -66

Wersja iteracyjna - jak widać wstawia przerwy nawet do najdłuższej sekwencji

GCT--GTCGACGG-A-TTCG-GG-GTG-GCGGTG
-C---G-A--AA----------------------
-C-TCG-A--GG-G-C---GGCGG-CGG-TG---
Alignment: -32

Rekurencyjna uruchamiasz z argumentem -r scala mbi-sequences_2.10-1.0.jar -seq ../../data/s1 ../../data/s2 ../../data/s3 -sm ../../data/similarity-matrix -r scala mbi-sequences_2.10-1.0.jar -seq ../../data/s1 ../../data/s2 ../../data/s3 -sm ../../data/similarity-matrix

[mklew]

Po poprawce wygląda to tak:

mareklewandowski~/mbi-sequences/target/scala-2.10$ scala mbi-sequences_2.10-1.0.jar -seq ../../data/s1 ../../data/s2 ../../data/s3 -sm ../../data/similarity-matrix

GCT--GTCGACGG-A-TTCG-GG-GTG-GCGGTG
-C---G-A--AA----------------------
-C-TCG-A--GG-G-C---GGCGG-CGG-TG---
Alignment: -32

mareklewandowski~/mbi-sequences/target/scala-2.10$ scala mbi-sequences_2.10-1.0.jar -seq ../../data/s1 ../../data/s2 ../../data/s3 -sm ../../data/similarity-matrix -r

GCTGTCGACGGATTCGGGGTGGCGGTGC
-C----GA-AAA----------------
-CT--CGA-GGG--CGG--CGGCGGTGG
Alignment: -32

[mklew]

Zamykam bo już poprawione