starskyzheng / panpop

Application of pan-genome for population
MIT License
87 stars 8 forks source link

处理二代数据报错 #59

Closed C-YONG closed 3 months ago

C-YONG commented 3 months ago

郑博士 你好 ! 我在处理二代数据的时候出现报错 另外 二代数据call SV的基因组只能是graph-genome或者pan-genome吗? 普通的基因组fasta文件是否可以? image

starskyzheng commented 3 months ago

不行,二代算是vg的召回,没有sv集没法算的。