statgenetJimu
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9 years ago db1 の /home/ryamada/github/statgenetJimu/ShapeMove/ はこのgithubのクローンです。そこに /Data/DICOM/WRIST RIGHT/なるDICOMデータを置きました(読み取り権限等、全員に許可してあります)。 これをITKで読むには
/usr/local/ITK-build/bin/DicomSeriesReadPrintTags /home/ryamada/github/statgenetJimu/ShapeMove/Data/DICOM/WRIST\ RIGHT/T2\ TSE\ AX\ FS\ RT./ -/ 3/ として、複数ファイルを持つディレクトリを指定するとできます。
というわけで、DICOMならファイルシリーズがITKで読めた状態までは来ました。
ゲノム医学センターのdb1でITKライブラリが使えます(MITKソース版も動いています) 使い方 １ アカウントを取得する→山田までご連絡ください ２ /usr/local/ITK-build にインストールされています ３ /usr/local/ITK-build/bin 以下にあるサンプル実行可能プログラムは使えます ４ 実行可能ファイルとそれをITKとつないでCMakeでビルドするCMakeLists.txtファイルをつくりましょう。http://www.itk.org/ItkSoftwareGuide.pdf の 2.2 Getting Started With ITK (pdf の page 36)でもよいです。以下の例はそんな感じ ５ 実行可能ファイルを作りたいディレクトリにて、コマンド cmake xpath と発行する。ただしxpathはCmakeLists.txtとソースファイルを持っているディレクトリ ６ そこにHelloWorldという実行可能ファイルができているので ./HelloWorldと打てば、実行されて、画面に"Hello"が出ます。 ７ あとは、ITKを使ってやりたい処理を書くだけ。まずはイメージファイルを読んで何かしてみるのがよいでしょう