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statgenetJimu / ShapeMove

ShapeMoveAnalysis Project
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vtkの調査～Rでのvtk #6

Open statgenetJimu opened 9 years ago

statgenetJimu commented 9 years ago

10 vtkとRとの関係：Rのmkdeパッケージ→example(plotMKDE)

ryamada22 commented 9 years ago

MKDEは生態学研究において個体の空間移動記録を解析するために作られたパッケージ。PLoS　ONEへのリンクはhttp://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0101205

statgenetJimu commented 9 years ago

Rのmkdeパッケージは３次元座標と時刻との４次元情報を扱う生態学用パッケージ。その中でvtk仕様のファイルを書き出すことがある。 書き出し関数は mkde::writeToVTK() vtk file format 仕様：　ftp://ftp.tuwien.ac.at/visual/vtk/www/FileFormats.pdf

statgenetJimu commented 9 years ago

以下の例は 第１行：「こう書く」 第２行：コメント行 第３行：使用文字・エンコード 第４行：記載データセットのタイプ(いくつかのタイプが使えるので、ここで分岐) 第５行：ここから「POINTS(点)」を８個分書くよ、値のデータ型はfloatだよ、という説明 第６－１３行：８個の点の３次元座標 第１４行：ここから「CELLS」という、辺だったり面だったり、四面体だったりするものを書くよ、１個書くよ、という説明 第１５行：CELLは８個の点からなるよ、0,1,2,...,7という、0始まりID付けなので、第１番から第８番までを結んだCELLだよ 第１６行：CELLのタイプは第12番タイプ(hexahedron)だよ ----ここからvtkファイルの例---

vtk DataFile Version 2.0

hexahedron ASCII DATASET UNSTRUCTURED_GRID POINTS 8 float 0 0 0 1 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 1 1 0 1 1 1 1 0 1 1 CELLS 1 9 8 0 1 2 3 4 5 6 7 CELL_TYPES 1 12

statgenetJimu commented 9 years ago

『VTK勉強会資料』という日本語の資料 on the web