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Customize journal and article metadata #485

Closed ovillamx closed 6 years ago

ovillamx commented 6 years ago

Hello,

My name is Omar Villa, I work in a mexican company named eScire. I was looking in your roadmap, meeting notes and issues, I think this isn't duplicated, sorry if that's the case.

I was wondering if it would be posible a function to allow editing "properties of the article", I mean, any way to edit aditional content of <journal-meta> and <article-meta> tags from the <front>. I see that now the editor support only some tags inside <article-meta>. It would be great a dialog box or something similar to edit this information, to clarify what I say, below I provide a real example according to SciELO Publishing Schema:

Published article: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-04712018000100206&lng=es&nrm=iso&tlng=es

Code:

    <front>
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            <journal-id journal-id-type="publisher-id">mb</journal-id>
            <journal-title-group>
                <journal-title>Madera y bosques</journal-title>
                <abbrev-journal-title abbrev-type="publisher">Madera bosques</abbrev-journal-title>
            </journal-title-group>
            <issn pub-type="ppub">1405-0471</issn>
            <publisher>
                <publisher-name>Instituto de Ecología A.C.</publisher-name>
            </publisher>
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        <article-meta>
            <article-id pub-id-type="doi">10.21829/myb.2018.2411131</article-id>
            <article-id pub-id-type="other">00206</article-id>
            <article-categories>
                <subj-group subj-group-type="heading">
                    <subject>Artículos científicos</subject>
                </subj-group>
            </article-categories>
            <title-group>
                <article-title>Repetibilidad de parámetros genéticos de las características de ramificación en progenies de <italic>Pinus patula</italic></article-title>
                <trans-title-group xml:lang="en">
                    <trans-title>Repeatability of Genetic Parameters for Branching Traits in <italic>Pinus patula</italic> Progenies</trans-title>
                </trans-title-group>
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                        <surname>Bustillos-Aguirre</surname>
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                        <surname>Vargas-Hernández</surname>
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                        <surname>López-Upton</surname>
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                <label>1</label>
                <institution content-type="original"> Universidad Tecnológica de la Tarahumara. Departamento Forestal. Cd. Guachochi, Chihuahua, México. cesar_pbr99@hotmail.com</institution>
                <institution content-type="normalized">Universidad Tecnologica de Mexico</institution>
                <institution content-type="orgname">Universidad Tecnológica de la Tarahumara</institution>
                <institution content-type="orgdiv1">Departamento Forestal</institution>
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                    <state>Chihuahua</state>
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                <email>cesar_pbr99@hotmail.com</email>
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                <label>2</label>
                <institution content-type="original"> Colegio de Postgraduados. Postgrado en Ciencias Forestales. Montecillo, Texcoco, Estado de México, México. uptonj@colpos.mx</institution>
                <institution content-type="normalized">Colegio de Postgraduados</institution>
                <institution content-type="orgname">Colegio de Postgraduados</institution>
                <institution content-type="orgdiv1">Postgrado en Ciencias Forestales</institution>
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                <label>3</label>
                <institution content-type="original"> Colegio de Postgraduados. Postgrado en Socio-economía y Estadística. Montecillo, Texcoco, Estado de México, México. gramirez@colpos.mx</institution>
                <institution content-type="normalized">Colegio de Postgraduados</institution>
                <institution content-type="orgname">Colegio de Postgraduados</institution>
                <institution content-type="orgdiv1">Postgrado en Socio-economía y Estadística</institution>
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                    <city>Texcoco</city>
                    <state>Estado de México</state>
                </addr-line>
                <country country="MX">Mexico</country>
                <email>gramirez@colpos.mx</email>
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            <author-notes>
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                    <label><sup>*</sup></label>Autor de correspondencia. <email>vargashj@colpos.mx</email>
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            </author-notes>
            <pub-date pub-type="epub">
                <day>09</day>
                <month>03</month>
                <year>2018</year>
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            <volume>24</volume>
            <issue>1</issue>
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                    <month>09</month>
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                    <license-p>Este es un artículo publicado en acceso abierto bajo una licencia Creative Commons</license-p>
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            <abstract>
                <title>RESUMEN</title>
                <p>La ramificación de los árboles tiene un impacto económico importante en las plantaciones forestales, ya que afecta la calidad de la madera. La posibilidad de incorporar estas características en un programa de mejora genética depende de su heredabilidad y estructura genética con la productividad de los árboles. El objetivo del estudio fue estimar la repetibilidad de los parámetros genéticos de las características de ramificación en progenies de <italic>Pinus patula</italic> a 7 años y 10 años de edad, así como su relación genética con la tasa de crecimiento de los árboles. Las características de ramificación (número de verticilos, número, diámetro y ángulo de ramas, y presencia de defectos en la ramificación) y crecimiento (altura, diámetro y volumen del tronco) se evaluaron en 84 familias de polinización libre. Con estos datos se estimó la heredabilidad y las correlaciones genéticas, fenotípicas y edad-edad de las características. El control genético de las características de ramificación varío de nulo a moderado (0.00 ≤ h<sup>2</sup>
 <sub>i</sub> ≤ 0.23; 0.00 ≤ h<sup>2</sup>
 <sub>f</sub> ≤ 0.42), pero fue estable en las dos edades. Las características de ramificación con variación genética mostraron una estructura genética favorable con las de crecimiento. El número de verticilos y el diámetro de ramas ajustado tuvieron una correlación negativa (-0.60 ≤ r<sub>g</sub> ≤ -0.01), y el ángulo de ramas una correlación positiva (0.14 ≤ r<sub>g</sub> ≤ 0.47), con el crecimiento de los árboles. La repetibilidad de la estructura genética de las características de ramificación y crecimiento de los árboles fue alta, en términos de las correlaciones edad-edad (0.58 ≤ r<sub>g</sub> ≤ 0.94; 0.83 ≤ r<sub>pf</sub> ≤ 1.00) y del coeficiente de correlación entre las matrices de correlaciones genéticas y fenotípicas en las dos edades (r ≥ 0.86). La selección individual o entre familias para aumentar la productividad en esta población causaría mejoras en la ramificación (menor número de verticilos y ramas más delgadas, con ángulo mayor) y, por lo tanto, en la calidad de la madera.</p>
            </abstract>
            <trans-abstract xml:lang="en">
                <title>ABSTRACT</title>
                <p>Due to their effect on wood quality, branching traits have an important economic impact in forest plantations. The potential for including these traits in a tree-breeding program depends on their heritability and their genetic relationships with productivity of trees. The objective of the study was to estimate the repeatability of genetic parameters for branching traits in <italic>Pinus patula</italic> progenies at 7 years and 10 years of age, and their genetic relationship with growth rate of trees. Branching (number of whorls, branch number, diameter and angle, and branching defects) and growth (stem height, diameter and volume) traits were evaluated in 84 open-pollinated families. The data obtained was used to estimate heritability as well as genetic, phenotypic and age-age correlations of traits. Genetic control of branching traits varied from null to moderate (0.00 ≤ h<sup>2</sup>
 <sub>i</sub> ≤ 0.23; 0.00 ≤ h<sup>2</sup>
 <sub>f</sub> ≤ 0.42), but it was stable at both ages. Branching traits with genetic variation showed a favorable genetic structure with growth traits. Number of whorls and adjusted branch diameter had a negative correlation (-0.60 ≤ r<sub>g</sub> ≤ -0.01), and branch angle a positive correlation (0.14 ≤ r<sub>g</sub> ≤ 0.47) with growth rate. Repeatability of genetic structure for all branching and growth traits was high, in terms of age-age correlations (0.58 ≤ r<sub>g</sub> ≤ 0.94; 0.83 ≤ r<sub>pf</sub> ≤ 1.00) and the correlation coefficient between the matrices of genetic and phenotypic correlations at both ages (r ≥ 0.86). Individual or family selection to increase productivity in this population would also improve branching traits on trees (fewer whorls and thin branches with wider angle), and thus wood quality.</p>
            </trans-abstract>
            <kwd-group xml:lang="es">
                <title><bold>Palabras clave</bold>:</title>
                <kwd>ángulo de ramas</kwd>
                <kwd>calidad de madera</kwd>
                <kwd>correlaciones genéticas</kwd>
                <kwd>diámetro de ramas</kwd>
                <kwd>heredabilidad</kwd>
                <kwd>respuesta a la selección</kwd>
            </kwd-group>
            <kwd-group xml:lang="en">
                <title><bold>Keywords</bold>:</title>
                <kwd>branch angle</kwd>
                <kwd>wood quality</kwd>
                <kwd>genetic correlation</kwd>
                <kwd>branch size</kwd>
                <kwd>heritability</kwd>
                <kwd>selection response</kwd>
            </kwd-group>
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    </front>
michael commented 6 years ago

Hi there!

We are working on standardising the metadata part, and then have Texture support editing it. This will be done over the next couple of months. I will add separate Github issues tagged with "requirements", please comment on them.

obuchtala commented 6 years ago

Our general approach is to identify the general concept behind JATS content, then come-up with a commonly agreed tagging guide-line, and one UI implementation. Entirely custom versions are not on our road-map for Texture.