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tderrien / FEELnc

FEELnc : FlExible Extraction of LncRNA
GNU General Public License v3.0
79 stars 28 forks source link

transcript_biotype #52

Closed kevinmuret closed 2 years ago

kevinmuret commented 2 years ago

Salut Thomas, Juste pour te prévenir que dans la version GENCODE 39 de l'annotation humaine de décembre dernier, la notion de gene_biotype et transcript_biotype est devenue gene_type et transcript_type. De souvenir, FEELnc récupère ce champ. Peut-être que cela génèrera du coup des soucis ? A bientôt ;) Kévin Muret

tderrien commented 2 years ago

Tx pour l'info @kevinmuret ! A bientôt!

tderrien commented 2 years ago

Après verification, on uniformise le tx {bio}type dans le Parser.pm! Merci again! ++