Fikse dependencies

[thomiz]

Sørge for at preinstallerte pakker blir lastet inn i container som kjører den faktiske byggeprosessen: Docker hl7 image Eksempel på bruk En annen metode med jobs og container kommando

[thomiz]

Action script for IG med dependencies

Oppsett actions og docker byggemiljø

• Byggeprosessen kjører i en github-action
• Action scriptet kjører på en ubuntu virtuell maskin hos Github, action scriptet har tilgang til alle filene i GitHub repoet og publiserer alle produserte filer til gh-pages branch
• For å bygge FHIR ig publisher kjøres det en docker container med byggemiljøet hl7fhir/ig-publisher-base inne i ubuntu maskinen
• Inne i byggemiljøet monteres GitHub repoet gjennom docker run kommandoen og -v opsjonen, slik at docker containeren har tilgang til filene fra Github repoet
• ig-publisher henter lokale pakker fra /home/publisher/.fhir/packages
• Arbeidskatalogen i docker imaget er /github/workspace (her monteres github repo opp)
• Når man benytter npm for å installere fhir pakker så legges disse under gjeldende katalog ./node_modules/
  • FHIR pakker må derfor kopieres til riktig sted i byggemiljøet for at SUSHI og publisher skal kunne ta tak i dem.

Sette opp fungerende dependencies

• Pakkene må inneholde snapshots (SIMPLIFIER ig repo gir dessverre pakker uten snapshots som default)
  • Det er derfor lurt å legge .tgz av pakkene man inkluderer i en snapshot katalog i repoet og installere pakkene derfra
• Pakkene må ligge på riktig sted.
  • /home/publisher/.fhir/packages
• Navnet på katalogene må være hl7.fhir.no.basis#2.1.2-beta
• Selve filene fra pakken må være pakket ut til hl7.fhir.no.basis#2.1.2-beta/package/
• Pakken må også inneholde en implementation guide json fil. Se eksempel på IG fil for [no-basis] (https://github.com/thomiz/test-IG/tree/derived-person/igs/snapshots/ImplementationGuide-hl7.fhir.no.basis.json)
  • SIMPLIFIER legger ikke med Implementation guide fil når de produserer pakkene så dette må legges til manuelt
  • ImplementationGuide ressursen må ha riktig version i version element (2.1.2-beta)
  • (Denne koden er kommentert ut av scriptet og er ikke lenger nødvendig)

Om bygging i docker

• enklest å lage et bash-script for å kjøre alle kommandoene som må til for å få inn snapshots i docker bildet som bygger IG'en
• Pakkene som lastes ned direkte fra SIMPLIFIER er ikke kompatible med SUSHI byggeprosessen siden de ikke inneholder snapshots
  • Pakker som inneholder snapshots må lastes ned manuelt fra SIMPLIFIER
  • FEIL: så må man manuelt legge til en ImplementationGuide fil (manuelt) (dette er ikke nødvendig det var men gammel SUSHI versjon)
  • Det hele må ligge på riktig sted slik at SUSHI og publisher finner dem når man bygger det hele ved hjelp av docker bildet (de må ligge inne i dockeren)
  • kopiering av filene fra node_modules katalogen til .fhir/packages katalogen må gjøres som en del av bash-scriptet
  • Det går ikke ann å kjøre kopieringskommandoen direkte fra github action scriptet (docker run hl7fhir/ig-publisher-base:latest cp node_modules/. /.fhir/packages) da får man bare FEIL "cannot stat 'node_modules/.': No such file or directory"