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tlubitz / SBtab

SBtab - Table format for Systems Biology:
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SBtabTools in sbtab_dict.py #87

Open liebermeister opened 4 years ago

liebermeister commented 4 years ago

Hi Timo,

kannst Du Dich um den Befehl "import SBtabTools" in sbtab_dict.py kümmern?

Vielen Dank !!

Wolf

tlubitz commented 4 years ago

Hi Wolf,

ich habe gerade versucht, das Problem zu lösen, war auch nicht schwer, aber es hat dann eher noch mehr Folgeprobleme ausgelöst: das Interface ist doch arg veraltet, es nutzt noch tablib und die alte tablibIO-Datei, die ich mal ins Paket integriert hatte. Das waren alles Altlasten, die das Projekt eigentlich eher schlechter gemacht haben, darum habe ich sie entfernt. Aber so geht das Skript jetzt natürlich nicht mehr. Ich denke, dass es nicht besonders viel Aufwand wäre, das Skript umzuschreiben, sodass es wieder funktioniert. Es wäre aber sehr viel besser, wenn sich Elad darum kümmert als ich. Es ist ja sein Code und ich glaube, er könnte da schnell durchsehen, was benötigt ist. Ich müsste mich erst mal reinarbeiten und schauen, welche Funktion was macht und wie ich es ändern kann. Das wäre ziemlich viel Einarbeitung für mich... könntest Du Elad bitten, das zu fixen, bitte? Gerne mit mir im CC, dann kann ich nochmal Details hinzufügen.

Liebe Grüße, Timo