If your site is deployed to a non-root URL, you will need to set the base option in .vuepress/config.js. For example, if you plan to deploy your site to https://foo.github.io/bar/, then base should be set to "/bar/" (it should always start and end with a slash).
Fix #3
https://vuepress.vuejs.org/guide/assets.html#base-url によれば
とのことなので、これが正しそうな気がします。が、このレポジトリのビルド方法わからなかったので手元で試せていません。全然違ったらすみません...