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Problemas para instalar vcftools #19

Open BarCS opened 4 years ago

BarCS commented 4 years ago

Buen día. Tengo problemas para instalar vcftools en mi computadora. Bajo el programa y cuando quiero descomprimir con unzipo tar me dice que no lo puede descomprimir. Hice lo siguiente: git clone https://github.com/vcftools/vcftools.git cd vcftools ./autogen.sh ./configure make make install

Cuando coloco ./autogen.sh me dice que no encuentra el comando autoreconf y entonces no puedo continuar. Otra cosa, cuando intento ocupar el comando wget desde mi computadora tampoco puedo, me dice que no se encuentra el comando, ¿por qué pasa esto?

Gracias.

AliciaMstt commented 4 years ago

Hola. No te preocupes. Vamos por partes. Sobre la instalación de vcftools. No entiendo cuál es exactamente tu problema. Dices que no lo puedes descomprimir, pero en el ejemplo de lo que hiciste no hay un unzipni un tar, entonces no sé cuando lo intentas hacer. Sé más explícita y copia pega el error exacto que te aparece (en vez de "me dice que no lo puede descomprimir") y con gusto lo resolvemos.

Otra cosa, cuando intento ocupar el comando wget desde mi computadora tampoco puedo, me dice que no se encuentra el comando, ¿por qué pasa esto?

wget sólo existe en Linux, no en Mac. Seguro ese es el problema.

BarCS commented 4 years ago

Hola:

  1. Descargué el programa con git clone http://github.com/vcftools/vcftools.git
  2. Cuando pongo unzip vcftools me dice: unzip: cannot find or open vcftools, vcftools.zip or vcftools.ZIP.
  3. Al parecer es por la forma que descargué la carpeta, entonces fui al interior de la carpeta con cd vcftools se ve lo siguiente: 
    License
Makefile.am
README.md
autogen.sh
build-aux
configure.ac
examples
scr
  4. Me voy a README.md y ahí me dice cómo instalarlo: 
    git clone http://github.com/vcftools/vcftools.git # De esta manera lo descargué
cd vcftools
./autogen.sh
./configure
make
make install

  5. Coloco ./autogen.shme dice: ./autogen.sh: line 3: autoreconf: command not found

    Y ahi me quedo.

Gracias por la aclaración de wget

BarCS commented 4 years ago

Hola Alicia:

Podrías ayudarme a aclarar mi duda de este Issue, ya estamos por empezar la segunda parte y quisiera lograr la instalación de vcftools en mi computadora, gracias.