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SAM-Med3D: An Efficient General-purpose Promptable Segmentation Model for 3D Volumetric Medical Image
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请问训练完了怎么进行预测的呀，预测文件是validation.py吗？ #37

Closed 111678900 closed 4 months ago

111678900 commented 5 months ago

请问训练完了怎么进行预测的呀，预测文件是validation.py吗？

blueyo0 commented 5 months ago

对的，但是validation目前只支持在有ground-truth的文件上跑个分验证。 无标签上直接推理参见 #22 的说明，目前没写这个内容，后面会提供的。

111678900 commented 5 months ago

您好我是有标签的为什么一直报错啊

---原始邮件--- 发件人: "Haoyu @.> 发送时间: 2024年1月27日(周六) 晚上10:34 收件人: @.>; 抄送: @.**@.>; 主题: Re: [uni-medical/SAM-Med3D] 请问训练完了怎么进行预测的呀，预测文件是validation.py吗？ (Issue #37)

对的，但是validation目前只支持在有ground-truth的文件上跑个分验证。 无标签上直接推理参见 #22 的说明，目前没写这个内容，后面会提供的。

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111678900 commented 5 months ago

您有相关运行过程的参考吗   (ಥ㉨ಥ)  

---原始邮件--- 发件人: "Haoyu @.> 发送时间: 2024年1月27日(周六) 晚上10:34 收件人: @.>; 抄送: @.**@.>; 主题: Re: [uni-medical/SAM-Med3D] 请问训练完了怎么进行预测的呀，预测文件是validation.py吗？ (Issue #37)

对的，但是validation目前只支持在有ground-truth的文件上跑个分验证。 无标签上直接推理参见 #22 的说明，目前没写这个内容，后面会提供的。

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blueyo0 commented 5 months ago

错误log是这个？set seed as 2023 get 2 datasets device: cuda 0it [00:00, ?it/s] Save to union_out_dice.py /usr/local/lib/python3.10/dist-packages/numpy/core/fromnumeric.py:3432: RuntimeWarning: Mean of empty slice. return _methods._mean(a, axis=axis, dtype=dtype, /usr/local/lib/python3.10/dist-packages/numpy/core/_methods.py:190: RuntimeWarning: invalid value encountered in double_scalars ret = ret.dtype.type(ret / rcount) Done****

这种debug问题或者细节问题的话，建议你加交流群来问（readme里有我的微信二维码），回答会及时一点，issues里的话我的回复频率会低很多。