chore: Update a dependencies

[akabekobeko]

安全そうな npm だけ更新。

prettier-plugin-organize-imports は .prettierrc に設定がなく利用されていないので削除した。現状、remark や ESM 系を最新にできないため、更新を求められる npm はなるべく減らしたいので重要度の低いものは外してゆく方針とする。