search

wchodor / DataArtists

Plans, organisation management, prototypes, discussions, beer, ladies and cats :)
2 stars 0 forks source link

Spotkanie w piatek 7 listopada #45

Closed MarcinKosinski closed 8 years ago

MarcinKosinski commented 8 years ago

Plan gry: TODO dzis wieczorem

MarcinKosinski commented 8 years ago

@wchodor

MarcinKosinski commented 8 years ago

Plan gry:

Myslalem, zeby sie spotkac, zebysmy mogli sobie w czwartek wieczorem poplotkowac, a w piatek bysmy zaczeli pisanie tych pakietow co mamy zalegle: #36 Chodzi o dopisanie kilku pakietow z danymi bazujac na juz stworzonych 3 pakietach z danymi.

Tutaj opisany jest sens udostepniania pakietow z danymi: https://github.com/mi2-warsaw/RTCGA.data/blob/master/rticle/RJwrapper.pdf

A tutaj jak mozna pobrac dane i stworzyc pakiet: https://bioconductor.org/packages/release/data/experiment/vignettes/RTCGA.mutations/inst/doc/downloading_mutations_datasets.html

Duzo kodu nie ma :P

Co Ty na to?

MarcinKosinski commented 8 years ago

o 15:00 jest jeszcze na politechnice seminarium grupy mi2 na ktorym jakis doktorant biecka bedzie opowiadal o jakies analizie. chcialbys sie przejsc? ja bym sobie przy okazji pogadal chwile z bieckiem o magisterce i moglibysmy pogadac o integracji archivista z beta_i_bit_package :)

wchodor commented 8 years ago
  1. Zaczałem czytać ten RJwrapper. Na razie jest to dla mnie czarna magia. Udało mi się zainstalować "RTCGA. clinical" oraz "RTCGA. mutations". Pozostałych mi się nie udało.
  2. Przygotowałem sobie to co zrobiłem przez ostatnie 2 i pół tygodnia (1 kartka A4).
  3. Teraz wyjeżdżam, do zobaczenia!