Images NIR dans le dossier ImgIRdrone

[AlainNeveu]

Avec l'option '--odm-multispectral' ce serait bien de remettre l'image alignée NIR_local au format .jpg dans le dossier .../dirMission/ImgIRdrone (à coté du redo.bat associé à cette image). Cela permettrait de voir si elle est bien alignée ou si elle a eu un problème. L'image VIR.jpg est moins précise pour cet objectif de contrôle visuel car la bande spectrale proche infrarouge (NIR) qui pourrait être mal alignée est placée sur la couche Red alors que les couches Green et Blue proviennent respectivement des couches Red et Green de l'image dans le spectre visible (VIS). Ces deux couches semble l'emporter dans le cas d'un petit défaut d'alignement.

[balthazarneveu]

Trace mechanism through command lines options

Added option to specify which traces you'd like to see in the output folder.

--traces {vis,nir,vir,ndvi} [{vis,nir,vir,ndvi} ...]
                        export specific spectral traces

• in case --odm-multispectral is not specified, If no argument is provided , all traces are exported by default (old behavior)
• in case --odm-multispectral is specified, 1/ If no --traces argument is provided , only VIR is exported. -> this it the default behavior you request in the message above @AlainNeveu 2/ If --traces argument is provided , selected traces are exported.

Solving the manual modifications in case of multispectral...

• [x] do not force XXXX_1.tif but rather the original naming 0001_1.tif should be HYPERLAPSE_102_1.tif
• [x] support multispectral_folder in automatic_registration.py so REDONE images can be reprocessed correctly

If I perform a "REDO.bat" and forcing a really bad initial alignment

I can see the multispectral folder being updated with the new NIR manually aligned tif.