По умолчанию метод \CIBlock::GetList() проверяет права доступа текущего пользователя к инфоблоку. Миграция из консоли выполняется от имени неавторизованного пользователя. Поэтому удаление и изменение инфоблока с использование билдера через консоль не сработают.
По умолчанию метод \CIBlock::GetList() проверяет права доступа текущего пользователя к инфоблоку. Миграция из консоли выполняется от имени неавторизованного пользователя. Поэтому удаление и изменение инфоблока с использование билдера через консоль не сработают.